9月3日，日本政府與所有者以“20億5000萬日元”的價格達成協議。次日，首相助理長島親自到石原家與其會麵並表示，“野田政權為了實現國有化會竭盡全力”。但他拒絕了東京都提出的為釣魚島建設港灣設施的要求。
日本政府在9月11日的內閣會議上決定對釣魚島實施國有化。據一位日本政府高官透露，土地所有者可能會臨時改變主意。這也是日本政府急於推進國有化的一個原因。
野田政權內部也曾對釣魚島港灣設施的建設進行討論，甚至為此擬訂了8套方案。也有人建議“為了強化實效支配，建設是必要的”，野田也一度積極考慮過此事，但他還是擔心中國方麵的反對。最終，政府選擇了隻是通過國有化將釣魚島的所有權從民間轉交給國家，並借此向中國方麵呼籲“維持現狀”的措施。
事態會演變至此，還是由於兩年前在釣魚島海域發生漁船撞擊事件。事件發生後中日關係緊張，雙方反思後均致力於意見溝通，才會產生目前“中日仍然保持著良好的溝通”的感覺。實際上，雙方的認識早已開始漸行漸遠了。
溫家寶總理在和野田的會談中重申了釣魚島是中國領土的立場。6月11日，在日本召開的中日副外長級戰略對話中，中國外交部副部長張誌軍對日本施加壓力：“對於破壞兩國政治基礎的行為應該堅決阻止。”
野田宣布日本政府將考慮對釣魚島國有化之後，中國政府的態度也開始變得強硬：“鬧劇始作俑者石原慎太郎拋出購島話題，最主要的目的就是向日本政府施壓。如今，日本政府決定出演鬧劇主角。”
4天後，3艘中國漁政船進入釣魚島海域。8月15日，香港保釣人士登上了釣魚島主島。到了8月下旬，中國各地開始爆發反日遊行。
據野田周邊人士介紹，野田提出國有化的想法後，日本政府開始著手對“宣布國有化後中國將作何反應”進行模擬演練。從政治、經濟、民間交流以及軍事等不同領域進行預測，反應的激烈程度從低到高作出評估，評估的項目多達幾十項。這些評估參考了兩年前撞船事件時中方的反應。
然而，麵對中國的強烈反對，外務省內持謹慎態度的聲音越來越多。8月末，首相辦公室再次召集“國有化問題研討小組”。一位外務省負責人建議：“在這個問題上國家最好不出麵，讓東京都去買比較好。”對此，野田語氣平緩地作出了最終決斷：“還是由國家來買吧。”
目前首相官邸正為應對連日來集結在釣魚島周邊海域的中國海洋監視船而發愁，並將海上保安廳的一半船隻投入其中。但野田對防衛大臣作出指示，要求自衛隊不要出麵。