中國新軍預見了世界的正確反應，卻沒有將之無限地寬容下去，畢竟，中國新軍有自己的利益在，所以，在會見了天皇以後，又開始對日本政府進行指導。
栗雲龍說：“指導日本政府的建樹更生，是我們中國新軍義不容辭，當仁不讓的責任。”
日本政府沒有異議，嚴格地說，是日本政府的前成員，因為，現在日本的政府還在戰俘營裏，剛剛得到釋放，連辦公室也沒有，就連吃飯還得找中國新軍施舍，不過是一群搖尾乞憐的叫化子。
在中國新軍的要求和安排下，日本新一屆政府迅速成立。
鈴木清秀仍然為政府的內閣總理大臣，又稱首相，然後，從現有的各界人等中抽取精英分子，山下賀國大將被中國新軍指定為軍事防衛長官。前原則為通產省和外務省的負責人。在政府要員以及相關的軍事係統中，由中國新軍軍團部指定的人員，占了一半。
日本政府的構架，也按照中國新軍的意見，做了相當大的調整。首先，它取得了全部的行政權利。換句話說，天皇被要求放棄對政府的指導和控製，獨立開來，成為自由的人，盡享榮譽和尊嚴，這一點兒非常重大，事實上，將日本的政體由二元製君主立憲方式轉變為真正的議會製度。議會開始成為日本政治的真正中心，而天皇則成為專職的精神領袖，道義之主。首相成為真正的權利者。考慮到現在特殊的形勢，中國新軍要求，這個政府為暫時的，過度性的政府，等待日本新憲法的起草頒布施行以後，再進行普遍的選舉，然後，確定政府和首相，閣員的任期等事項。
第二，軍事係統取消半獨立的狀態，完全納入日本政府的體係。以前，日本的政治軍事中樞，是以天皇為核心很奇怪地分裂的。軍事係統以軍部為核心，在戰時則組建大本營，更進一步地貼近天皇，甚至淩駕於政府，政府首相的很多指令，它根本不聽，在戰前的大山岩政府的獨斷專行年代，軍事人員出任了首相，居然將政府完全控製了。現在，出於降低日本軍事人員的地位和權利的考慮，歸化之於政府統一管轄。取消軍部，大本營等設置，改以陸軍省和海軍省，空軍省等名目。同時，將全部的日本軍事力量，縮小為防禦性的武裝團體，連名稱也修改為軍事防衛部隊。
山下賀國大將，作為親善中國新軍的代表，忠心耿耿的代理人，擔任軍事長官，但是，並不能夠控製全軍，在臨時狀態結束以後，將取消這一職務。由三省的長官向首相負責。目前，中國新軍已經指定了所有的三軍指揮官，他們分別是，陸軍省，山下，海軍省，金口，空軍省，豬口，將九州的三大名，全部升級到中央政府中。
在政府機關巨大變化的時候，地方體製沒有變化，中國新軍表示尊重日本政府的地方行政管理，不加幹涉，讓他們大大地鬆了一口氣。
中國新軍派遣了多名官員，到日本政府主持工作，特別是日本新軍的建設。
將之前所有的日本軍隊，盡皆解散，罷免一切軍官的職務。而以忠誠於中國新軍的部隊，一路追隨參戰的日本新軍為核心，整編部隊。
九州部隊，四國的投降軍，本州等曆次戰場上的投降者，被打散編製。首先確定了人數，中國新軍要求，日本的軍隊，最大數量，不得超過八萬。其中，陸軍不得超過六萬五千人，海軍不得超過一萬人，空軍不得超過五千人。
日本軍隊可以擁有三軍的建製，機構，名稱一律為日本防衛隊。
山下賀國，金口，豬口三位，全部確定為大將軍銜。
日本的將級軍官，特別是技術型將領，總數不得超過二十人。
凡是一切具有擴張主義，軍國主義傾向的軍官。或者現在有對中國新軍憎惡態度的軍官，立刻解職。
關於陸軍方麵，在具體的問題上，中國新軍也做出了嚴格地研製。
例如，武器裝備。舉凡日本防衛軍的武器彈藥，禁止自行生產，一律從中國新軍的奉天兵工廠采購。以銀本位製度現金結算。任何關於武器方麵的研製和生產的活動，都被視為非法，將要遭到嚴厲的製裁，日本政府自己更是要警惕和采取措施，否則，將要負責連帶的責任。
日本新編防衛軍，全部使用中國新軍製造的標準步槍，整個陸軍，可以擁有三十挺機槍，騎兵作為快速反應部隊，被限製在一千人。關於炮兵，中國軍隊嚴厲要求，其總數不得擁有一百以上的野戰大炮，口徑在二百八十毫米的以前日本特別製造的海岸防衛大炮一百餘門，必須全部交給中國新軍，熔化消滅。