原因找到後，肖遠將鑽進god程序代碼段隱藏起來的種子抓了出來，卻沒有對它的主體進行修改，但是為了便於觀察，肖遠在種子進化出的代碼的基礎上，給它增加了一個監視模塊，並將這個模塊的規則設置成必須存在，這樣做是為了防止種子在繼續進化的時候，將這個模塊給破壞掉。
將種子改造完之後，肖遠將被破壞掉了的god程序恢複了正常，並將種子發現並利用的那個漏洞給打了補丁，但是為了驗證他的想法，他在將漏洞堵掉的同時，有刻意的加入了另一個漏洞。
搞完這一切之後，肖遠運行了god程序，一個初始狀態的世界被創造了出來，種子隨後被放了進去，靜態平衡瞬間被打破了，god和種子之間的新一輪對抗開始了。
因為這次放進去的是進化後的種子，god監控程序繪製出來的圖像上能夠看得出來，它在進到世界之後，比起最初的版本進去後對god的圍追堵截疲於應付的情況來，顯得輕鬆自如的多，以至於世界內隻看到種子在快速的到處移動，所到之處，引起的波瀾卻小了很多，而在它離開後，原本激蕩的波瀾也不會持續多久，就快速平息了下來。
肖遠沒有去過多關注這個圖像，他將這個監控程序扔到了後台，將剛剛植入種子的監控模塊調了出來，這個模塊會將種子程序的每一步操作記錄下來，並將之存儲成一個標準的記錄文件。
為了減少種子的代碼長度，肖遠設計的種子的監控程序記錄下來的操作是二進製機器碼，因此他如果想要閱讀這些操作，還需要進行進一步轉換，這個轉換肖遠用到了另外一個分析工具，這個分析工具讀取記錄文件，並實時將每一步操作反彙編成彙編程序顯示在他的一個側窗口中，而彙編語言雖然讀起來不如高級語言那麼清晰，但是閱讀彙編語言對於肖遠來說，並不是什麼難事。
仔細觀察著這些彙編代碼，肖遠發現種子在進入世界後，並沒有馬上去入侵那個已經被肖遠堵住的漏洞，而像是在適應著環境，很長一段的彙編操作，都是利用彙編的跳轉命令，在內存空間跳轉，跳轉，再跳轉，不停的變換著自己的方位。
當然在變換方位的時候，它還做了其他一些操作，其中最讓肖遠感興趣的是它在轉移後對原來現場的清理，肖遠在編製這個程序的時候，給出的設定規則是，當種子利用跳轉命令從一個內存區域離開的時候，它在原來區域造成的不平衡會棄之不顧，恢複平衡的工作完全交由god程序來完成，這種策略就像一個旅遊者在某一個地方製造了一堆垃圾，離開時完全不理會，清理工作將會有景區的清潔工來完成。
但是現在的情況是，這個旅遊者好像變得文明了，他離開之前，將垃圾清理，甚至還幫著將他弄亂的環境給恢複了原狀，種子跳轉離開後，會將他原來搞得失去平衡的區域重新恢複平衡。
看到這裏，肖遠將這種情況和god監控程序顯示的情況進行了對比，發現兩者是一致的。
種子為什麼會進化出這樣的功能出來，肖遠有些想不通，他以人類的思維考慮了一番，覺得如果他要是到了一個地方，被這個地方的人追殺，為了順利逃脫，他一定會竭盡所能將這個地方徹底攪亂，而不是反其道而行之。
這樣的情況持續了一段時間，情況開始有了變化，種子每過一處都會自己清理現場，必然會耗費一定的計算時間，反過來說，也給god節省了大量的計算時間，此消彼長間，種子有六次被god都被god將代碼段給破壞掉了。