當國防部長的時候，蓋茨喜歡做地下活動。他通過國家安全委員會為一項旨在推翻菲德爾·卡斯特羅的四點計劃出謀劃策，四點計劃是以慘敗告終的豬灣事件的早期藍圖。他敬仰國務卿約翰·福斯特·杜勒斯，後者經常到蓋茨家出席晚餐。盡管艾克下令中央情報局中止U——2偵察機的研製，蓋茨還是深入地參與了這個偵察機的活動並授權最後試飛。在當摩根董事長的時候，他不無留戀地說："那個U——2簡直不可思議！我常夢見U——2。"32恰逢艾森豪威爾赴巴黎與尼基塔·赫魯曉夫高峰會晤前夕，U——2偵察機被擊落，蓋茨建議總統承擔責任。在劍拔弩張的會晤過程中，他將美國軍隊處於戰備狀態，這一舉動使得人們更加眾說紛紜。沃爾特·李普曼說："選擇此時進入戰備狀態，比在會晤前兩周把U——2送上凶多吉少的旅程還要稍微糟糕一點。"33在約翰·肯尼迪就任總統的前一天，蓋茨向他彙報工作，他描繪出一幅老撾即將倒向共產黨的可怕畫麵，並建議美國適度介入。他說美軍大約需要幾周時間進駐老撾。原先的計劃是重新任命蓋茨為國防部長，鮑比·肯尼迪為副部長，一年後再由鮑比接任部長。但這個計劃遇上了麻煩，因為約翰·肯尼迪的顧問指出，肯尼迪競選演說中提到的美蘇"導彈差距"與蓋茨的重新任命兩者相互矛盾，會讓總統難堪。後來福特汽車公司的總裁羅伯特·麥克納馬拉當了國防部長。亨利·福特二世建議兩人"交換"——蓋茨任福特汽車總裁，羅伯特·麥克納馬拉當國防部長。通用電器公司也請蓋茨當家。但是，蓋茨卻選擇了摩根。他的女婿喬·蓬斯說："他說他從來就是個銀行家，不想學如何製作烤麵包機。"34蓋茨給摩根銀行帶來一種輕鬆的工作方式。一位下屬仍然記得蓋茨與吉米·林之間的一次會談。吉米·林是收購欲強的大型航空和電子公司林——特姆科——沃特的總裁。蓋茨滔滔不絕地講述自己對戰鬥機的喜愛和熱情，而林則不斷地問摩根能不能資助他收購威爾遜體育用品公司。"沒問題，吉米。"蓋茨答道，然後話題又回到他熱愛的戰鬥機上。最後蓋茨派一位下屬同信貸政策委員會的負責人斯圖爾特·克拉金談這件事，克拉金越級否定了蓋茨的草率決定，並直截了當地回絕了林的申請。摩根因而成為華爾街上第一家中止林購買計劃的銀行。
蓋茨從來不曾完全從政治狂熱中冷靜下來。他不僅是艾森豪威爾的好朋友（艾森豪威爾主動支持他競選參議員），也是後來兩位共和黨總統理查德·尼克鬆和傑拉爾德·福特的好朋友（他的下屬猜測也許蓋茨桌上的第二部電話是直通白宮的熱線）。他的關係網無所不在：他參加了一個專門的組織，1954年該組織由位於舊金山的一家隱秘建築公司的老斯蒂芬·比奇特爾和摩根的一位活躍的部門經理共同組建。在卡萊爾飯店，比奇特爾定期召集課題組開會。該課題組成員包括泛美公司創始人胡安·特裏普、德士古總裁奧古斯塔斯·朗、盧修斯·克萊上將，以及蓋茨。在這些喝著白蘭地，抽著雪茄的討論中，比奇特爾總是談論沙特阿拉伯和伊朗分析石油價格走勢，蓋茨闡述北約及俄羅斯威脅。35蓋茨總是運用他眾多的關係，擴大摩根在全球的影響。
在肯尼迪新任總統之際，沒有人能預見60年代銀行業向海外挺進的形勢。顯而易見，如今總統不得不阻止美國資金的大規模外流。
1962年初，艾森豪威爾召集他的舊內閣成員及共和黨領導人開會。阿瑟·伯恩斯的一席話讓湯姆·蓋茨印象頗深，他警告說持續不斷的美元和黃金外流會嚴重地損害美國的收支平衡，約翰·肯尼迪將不得不采取極端措施。蓋茨提醒亞曆山大，伯恩斯"認為剩下的唯一辦法就是直接管製。雖然政府不願意直接管製，但迫於形勢他們很可能不得不這麼做。"36摩根財團迅速地做好了準備，以迎接一個美國跨國公司在海外籌資的新時代。正如亞曆山大所言："商業發達，銀行興旺。"1962年底的一天，亞曆山大主持一個情緒激昂的會議，提出了一個30年來聞所未聞的問題：摩根財團要不要重操承銷證券的舊業，這回是在巴黎？聯儲做了一個讓華爾街23號小有驚訝的決定（這個驚訝銀行家們是心照不宣的），並通過了一項暫行規定：格拉斯——斯蒂格爾法案在美國境外並不構成障礙。但是，這樣做經得起法律推敲嗎？人們對此戰戰兢兢。當時在摩根銀行工作，後來任駐法大使的埃文·加爾布雷思回憶說："高層決策人員中有另一派不願這麼幹，這容易被人們看成是打擦邊球，但亨利對此充滿希望。"亞曆山大在屋子裏轉來轉去，聽取不同意見。最後，他力排異議，說："好了，我想這就是你們所說的業務決策。"37該決定計劃在巴黎建立一個證券承銷分部，名叫摩根股份有限公司。摩根建富及荷蘭米斯——霍普公司是該公司不參與決策的小股東（自從與擔保銀行合並後，巴黎的"摩根公司"這個名字就暫時不用了）。但是由於滿足於美國國內業務，摩根士丹利不屑一顧地拒絕了這第一份進入歐洲的請柬。