為了加強皇權，康熙帝設立了南書房。南書房本來是康熙帝與翰林院詞臣們研討學問、吟詩作畫的地方。在翰林等官員中，“擇詞臣才品兼優者”入值，稱“南書房行走”。入值者主要陪伴皇帝賦詩撰文，寫字作畫，有時還秉承皇帝的意旨起草詔令。由於南書房“非崇班貴檁、上所親信者不得入”，所以它完全是由皇帝嚴密控製的一個核心機要機構，隨時承旨出詔行令，使得南書房“權勢日崇”。這是康熙帝削弱議政王大臣會議權力，同時將外朝內閣的某些職能移歸內廷，實施高度集權的重要步驟。康熙帝親政以後，逐步形成以南書房為核心的權力中心。
清朝為官要能跪
世宗雍正皇帝時，設立了軍機處。軍國大事，皇帝裁決；軍機大臣，跪受筆錄。
明清兩朝，大臣上朝都得跪著。今天皇上單獨召見你六個鍾頭，你就得在地上跪六個鍾頭。如果是老臣，皇帝體恤，賜氈墊，你跪墊子上。年輕人就得跪地上，那你膝蓋得好使。大臣上朝之前，護肘護膝都裹好了，得在家練跪功，你跪一會兒暈了可不成。劉墉他爹劉統勳就是跪死的，也有說是上朝死在路上的。劉墉當老師愛遲到、早退，也不認真教書，不批改作業。皇上挺生氣的，看在你爹的麵子上讓你教皇子，你怎麼這麼不敬業？
軍機大臣“跪受筆錄”，就是跪在地上把皇帝命令記下來，以奉旨、上諭的形式廷寄出去。不像電影裏演的那樣，那種“奉天承運，皇帝詔曰”的聖旨，一年發不了幾回。那得是大事，譬如立皇後、跟外國宣戰、選進士這些事，才“奉天承運，皇帝詔曰”。一般就是“奉旨”或者“上諭”如何如何，軍機處起草。
紫禁城是前朝後寢，以乾清門廣場做分界線。前朝是太和、中和、保和、文華、武英五組宮殿建築群，比較疏闊。太和殿前廣場三萬多平方米，可以舉行大型活動，這是辦公的地方。乾清門廣場後邊就是寢宮區，中路也是三殿：乾清宮、交泰殿、坤寧宮，後邊是禦花園，兩側是東西六宮。清朝從雍正皇帝開始，住在養心殿，皇帝平時也在養心殿辦公。
乾清門廣場東為景運門，西為隆宗門，都是五間三開門。景運門內北側排房為文武大臣奏事待漏之所，也叫九卿房，南麵朝北的房間是宗室王公的內朝房。隆宗門內北側排房為侍衛值房及軍機處，南麵朝北的房間是軍機章京辦公的地方。門對門五十米，一排小平房。晚上內宮一落鎖，宮裏隻有五個男人：皇上、兩個太醫、兩個軍機章京。軍機章京就在軍機處值班，處理夜裏來的緊急軍務。除了這五個男人，連成年皇子都不許進內宮，隻能住在王府。如果沒有封王的話，就住在北五所。
軍機處裏講究多
軍機處有一個規定，不奉聖旨，擅入者斬。即使你是親王，不奉聖旨擅入，也要斬。
清末的時候，湖廣總督張之洞奉詔進京，商議官製改革。他走到軍機處，到台階底下，說什麼都不肯再往前多邁一步。張之洞那麼大的份兒，他都不敢邁一步，因為他不是軍機大臣，不能進軍機處。慶親王奕劻是軍機大臣，就對張之洞說幹嗎呢你，腿抽筋了？快來呀來呀，哦對，突然想起來了，他們天天走習慣了，沒覺得進軍機處有什麼不合適。張之洞真懂規矩，因為世宗皇帝遺訓，沒命令敢進來宰了你。
軍機大臣平時早上三點多鍾起來，就得到這兒值班。皇上一般七點鍾起床，清朝的皇帝一個個都精力旺盛，像康熙爺、乾隆爺整宿整宿不睡覺，觀書達旦，一晚上一晚上看書。而且清朝的皇帝都勤政，那真是中國曆史上罕見的。放在以往的王朝都是不世出的聖主，隨便拿出一個皇帝來（同治帝差點兒），即使把光緒皇帝擱到明朝，都是有道明君。可惜他趕上的時候不好，甲午戰爭。但你要對比著看，要是明朝那些皇帝趕上鴉片戰爭，咱就印度了，徹底變殖民地了。
清朝的軍機處都快設到寢宮裏邊了。寢宮裏邊住的是皇上、皇上家人以及伺候皇上家人的人。這麼說來，這軍機大臣的地位，其實跟宮女、太監真差不多。軍機大臣位當前朝宰相，但實際上和皇上大秘書差不多。皇上並不是每天都上朝，但每天一定要見軍機，皇帝一說叫起兒，就是叫軍機。要是六部九卿都來，那就叫大起兒。軍機處設置，議政王大臣會議名存實亡，到乾隆時撤銷。軍機處一直到1911年才裁撤。