第三個階段（20世紀10年代）出現分裂。在第二次國際精神分析大會上，弗洛伊德作了題為《精神分析療法今後展望》的演講並正式建立國際精神分析學會，在他的安排下，榮格任第一任主席。後來阿爾弗萊德·阿德勒因理論觀點分歧退出國際精神分析學會，另組自由精神分析學會，開創個體心理學。1913年在慕尼黑召開的第四次國際精神分析學會大會上，榮格極力反對弗洛伊德的觀點並於1914年也退出了學會，自立分析心理學大旗。本時期弗洛伊德主要發表了三個係列論著：一是精神分析運動的曆史，包括《精神分析引論》等；二是《壓抑》、《潛意識》、《有關移情的觀察報告》等12篇文章；三是《圖騰與禁忌》，書中用精神分析研究了原始道德和宗教。
第四個階段（20世紀20年代）成效卓著。隨著戰爭的結束，弗洛伊德事業走向了成熟期。他的醫療工作又興旺起來，寫作也更為勤奮；在學術上他對自己的學說進行了補充、修正，使精神分析由治療方法發展成闡述人類動機和人格的理論。從1920年到1925年出版的主要著作有：《超越快樂原則》、《自我和本我》、《壓抑、症狀和焦慮》、《群眾心理學和自我分析》等。這時，精神分析學說在世界各地已有了深遠的影響。1920年以後，僅美國就出版了200多部論弗洛伊德精神分析的書。有人感慨道，十多年以前，有誰曾夢想過，今天的大學教授們會向男女學生講授弗洛伊德的理論。科學家依靠它，以探求本能的奧秘；教育家希望從中找到訓練年輕人的秘訣；小說家受到啟發，得以分析人物更複雜的內心世界。弗洛伊德曾兩次被提名諾貝爾獎候選人。對此，他說道：“我已經兩次看見諾貝爾獎從我麵前閃過，但我知道，這種官方的承認根本不適合我的生活方式。”
最後一個階段（20世紀30年代）成就輝煌。弗洛伊德帶著病痛堅持研究工作，迎來了事業上的高峰期。從1930到1939年間，他的主要代表作有《文明及其缺憾》和《精神分析引論新編》，後一本書是理解他思想體係的關鍵性著作。他還發表了《為什麼有戰爭？》和《摩西與一神教》。《一個幻覺的未來》是他的宗教觀的主要代表作。他去世的第二年，他一生的最後一部作品《精神分析綱要》問世。《精神分析綱要》對精神分析理論作了全麵而精辟的總結，具有獨特的價值。書中闡述了本我、自我和超我相繼發展而成的精神結構；具有根本性作用的生的本能和死的本能；闡述了精神疾病的早期根源及其精神分析治療技術；揭示了精神世界與外部世界的關係。
除了心理學方麵的貢獻，弗洛伊德在文學方麵也有很深的造詣，發表了一係列對藝術家及作品中的人物進行精神分析的論文。如《戲劇中的精神變態人物》（1942）、《達·芬奇對童年時代的一次回憶》、《陀思妥耶夫斯基與弑父者》及分析莎士比亞等名人作品的論文若幹。1930年，法蘭克福市授予他歌德文學獎，以表彰他在開創文學研究新領域中的卓越貢獻。
弗洛伊德在其70壽辰之際，曾收到愛因斯坦等人的賀電；作家茨威格則在報紙上發表了祝辭。此時的弗洛伊德已譽滿全球。到他80大壽之日，他收到了諾貝爾獎金獲得者——法國著名作家羅曼·羅蘭等191名作家、藝術家集體署名的禮狀，連續6個星期，發自世界各地的心理學家及各界人士的賀電賀信雪片似地飛來。雖然弗洛伊德因病未能出席，但慶祝會依然開得隆重而盛大。
但弗洛伊德的一生並非一帆風順，相反，他的一生經曆了不少慘痛的悲劇，這一次又一次的不幸使他受到沉重的精神打擊。1934年，因為政治原因，帶著猶太血統的精神分析家都紛紛逃離了德國。納粹侵入奧地利時，弗洛伊德全家未能躲過納粹黨徒的迫害。女兒被捕，4個妹妹被殺。1938年奧地利被並入德國版圖，弗洛伊德在多方救助下才離開奧地利，逃到了倫敦。