比較製度分析方法認為，經濟整體實際上是多種製度相互結合的一個體係，在這個體係內部，各製度之間存在多樣性的聯係，可能是互補的，也可能是戰略替代關係。對於企業所有權的選擇來說，不同的製度約束所起的作用是不一樣的。家族所有權與非正式的家族文化之間是互補的，與差的投資者保護的法律以及不完善的資本市場和經理人市場之間是單向替代的，選擇家族所有權是對這些製度約束的一種製度適應，其背後有降低交易成本的經濟意義。
一、製度互補：家族所有權與深厚的儒家文化傳統
製度互補的概念來自青木昌彥提出的比較製度分析方法。青木昌彥認為，在現實經濟中存在的多種製度之間，經常可以看到通過一個製度的存在、運作而導致另一個製度存在或者更加鞏固的關係，這樣，雙方就形成了製度上的互補關係。青木昌彥認為，一個社會的經濟體製是由眾多互補的製度相互作用形成的體係。
東亞國家企業中由家族掌握企業所有權與東亞儒家家族文化傳統是同質的製度安排，兩者間是一種製度互補關係：一方麵，深厚的家族主義的文化傳統是東亞家族所有權存在的文化製度基礎，同時也決定了家族企業所具有的經營管理特點；另一方麵，在家族掌握所有權的企業裏，必然要強調家族主義的文化價值觀，宣傳並利用這種家族主義文化，這就在客觀上起到了在社會中弘揚、鞏固這種家族主義文化的作用。
首先，家族主義是家族所有權（或家族企業）存在的製度基礎。在東亞，家族主義成為人們共同擁有的信念，它滲透到個人、組織及國家的行為當中。家族主義對個人及企業組織的滲透，影響企業的性質、所有權安排和企業的運作方式。當一個人想做生意時，他會先想到和家裏人一起幹，家族血親關係成為企業的一大資源，可以幫助企業籌集資金，提供人力資本和社會關係，他會把這個企業控製在自己和家人手中；當他管理企業時，會不自覺地運用家庭中的倫理規則，認為自己是企業中的家長，奉行家長製和等級製，當他的企業小有成就時，他會更加努力，希望能借此光宗耀祖，當他年老時，會想著把企業傳給自己的孩子或親戚，千萬不能落入他人手中。他的家人和他有同樣的想法，因為他們共享同一種信念。在這種信念下建立的企業毫無疑問帶有家族企業的色彩，企業的所有權和控製權顯然都掌握在家族手中。可以說，家族企業是儒家文化的家族主義在組織形式上的外在反映，儒家文化中的家族主義是家族企業產生的深厚的文化基礎。
其次，家族企業對家族主義文化的強調和利用反過來鞏固了家族主義文化。家族企業所奉行的家族主義不僅是一種文化價值的體現，同時還包含著強烈的實用主義和功利主義的價值原則。家族主義表現為一個具有工具意義的價值觀，因為其基本原則具有良好的經濟價值，如抵禦風險、降低交易成本、利用機會、相互支持等。要更好地實現這些經濟價值，需要在企業中強化、鞏固這種家族主義，並與可能存在的個人主義等非主流的文化相抗爭。於是，我們看到，在許多家族企業中，老板刻意營造家的氛圍，強化家族成員間的親情，用婚姻、結拜兄弟等方式擴展家族成員，對家族成員和非家族成員實行不同的待遇以強化家族關係並吸引外部人進入家族等等。這種對家族主義的強調和重視自然會鞏固現有的家族文化。當然，從整個東亞地區來看，近30年來東亞家族企業的快速發展也使儒家文化受到世界的廣泛關注，在全世界範圍內掀起了研究儒家文化的熱潮。歐美的學者和企業家都在思索為什麼東亞的家族企業有如此強大的競爭力，儒家文化是否可以借鑒到歐美企業的經營管理中，如何實現西方文化與東方文化的融和等問題，這些研究在客觀上也鞏固並發展了儒家的家族主義文化。
二、製度替代：家族所有權與不完善的法律製度和市場體係