為什麼朱有孝對此事這麼快定奪呢，他就怕等下東林黨人提出袁應泰來，這樣就不好辦了。他知道在曆史上就是袁應泰接的熊廷弼，就在天啟元年三月丟失了遼東的沈陽、遼陽，袁應泰自殺，總兵官尤世功、賀世賢戰死。袁應泰並非是個廢物，也是個人才，但是他的才能並不在於軍事策略，他的能力表現在經濟和後勤保障上，所以遼東失利的責任並不在他，而在於朝廷之上。
接下來，首輔方從哲、次輔韓爌一致推薦朱國祚擔任戶部尚書。朱國祚，朱有孝也知道此人，此人有“六部尚書”之稱。因為萬曆皇帝多年不上朝致使官員缺額嚴重，南京的六部尚書就隻有一個朱國祚在支撐著。
散朝後，群臣都向外走，這時王安喊道：“楊大人慢行，陛下召您到內廷議事。”
楊漣一愣，心說肯定是熊廷弼的事，於是就跟著王安進了朱有孝的書房。進門一看，隻見東廠提督宋晉也在這裏候著，就肯定了心中的疑惑。
朱有孝換了便裝進來道：“給楊大人賜座。”
王安就給楊漣搬過來一個秀墩，“不敢勞駕公公。”楊漣客氣道，隨著微微坐下半個屁股。王安隨後出去，屋裏麵就剩下朱有孝、楊漣、宋晉三人。
朱有孝道：“我今天之所以把你二人叫來，想必二位也知道緣由。今天早朝，馮三元突然彈劾熊廷弼，而遼東總督楊淵自作主張逮捕熊廷弼，這裏麵肯定有什麼不對的地方。楊漣你的任務就是悄悄的把熊廷弼接出來，安置到朕的皇莊，你告訴他，朕不會讓他受冤枉的，會給他一個公道。宋晉，你的任務是，其一不能讓任何人知道熊廷弼已經放出，協助楊大人秘密送出熊廷弼；其二秘密調查馮三元、姚宗文、顧慥三人在京的所有家庭財產、人事交往動向。這些事情非常機密，一旦泄露二位知道這意味著什麼。”
“臣，（奴才)遵旨，倘若泄密臣（奴才）必以死謝罪。”二人同聲應道。
與此同時，在北京城裏一個簡陋的小胡同口，停下一乘小轎，從小轎裏下來的正是吏部尚書周嘉謨，周嘉謨進入一個普通的小院，裏麵走出一位老者，隻見此人相貌奇偉，“鐵麵劍眉，須髯戟張”。
“恭喜孫大人。”周嘉謨進門先道喜。“今天是要來討杯酒喝的。”
就在這時隻聽門外一片喧鬧，門口進來一公公，張口問道：“贖咱家眼拙，那位是孫承宗大人？”
孫承宗道：“下官就是孫承宗。”
那公公道：“孫承宗接旨。奉天承運，皇帝詔曰：孫承宗進士出身，素有才幹；曾為帝師，自作表範；今關東有變，特敕封為帝師，加太子少保，任命為兵部右侍郎兼右僉都禦史，賜尚方寶劍，代朕巡視遼東，以鎮宵小。欽此。”
“謝主隆恩，臣必不負陛下的恩典，鞠躬盡瘁死而後已。”孫承宗跪倒接旨，內心非常激動。也是啊，誰不盼著這官越做越大呀。
隨後孫承宗跟著太監進宮謝恩，朱有孝就在書房和孫承宗進行了被史稱為“隆中對”的談話。從此君臣二人合作，開辟了大明朝的新天地。