關於信仰問題，朱有孝感到這是一個非常令人頭疼的事情。在原始的中華大地上，有許多不同的原始信仰，包括對自然的崇拜、對祖先的崇拜，還有許多精英人物的崇拜。但是對於真正的信仰，並沒有多少，最多就是信仰老天爺，認為老天爺主宰者天下的一切事物，而皇帝就是天子，代表老天爺的意思。至於儒教、道教，隻是人們修身養性的一種方式，佛教的傳入，開始也不是那麼順利，後來摻進了中國的原始崇拜以後才開始在中華大地流傳，但也是幾興幾衰。
後世人形容伊斯蘭教的信仰者是一手拿著《可蘭經》，一手舉著利劍，信仰我者就是我的兄弟姐妹，不信仰我者，就是我的敵人，當我搶光敵人時，搶無可搶時，連我的兄弟也可以搶劫。它奉行的是自私的道德行為，但是也符合所有強者的行為，因此能夠從中東一偶傳及到亞非歐各地，但是在其發源地卻到了搶無可搶的地步，在猶太人強大的財力麵前進退維穀，反而是內鬥不止，這由於他們的信仰武力征服而缺乏建設造成的，除了地下擁有豐富石油的國家之外，富裕的國家幾乎沒有。
後世的的國人，無論信佛，還是信神，無非是做了壞事拿出一些祭品送到廟宇，祈求神靈護佑，被西方人認為是見不得人的行賄受賄的另一種表現形式，並且形成了世人都在行賄受賄中生活。
反觀基督教的信仰者，他們教育別人接受上帝的安排，自己就是上帝的羔羊，而他們自己確實手持利劍，大殺四方，當他們困乏時就向上帝祈禱，讓上帝的使者，就是那些神父之類的，向他們訴說自己的罪過，然後等到吃飽喝足了，再舉著利劍大殺四方，早就忘記了自己的懺悔。這就好比有福我享，殺你那是我代替上帝對你的懲罰。最明顯的例子就是以米國為代表的聯軍，在中東的大地上大殺四方，然後留下一地雞毛，讓他們自己去收拾。但是在他們和清朝的戰爭時，卻是在堅船利炮後麵伴隨著無數的神甫，把戰爭中得到的紅利，利用宗教的名義，再拿出一點殘羹冷炙去收買華人的民心，傳播上帝的福音，企圖在精神上徹底控製華人。在菲律賓這一點他們做的非常高明，但是在強大的中國儒家文化麵前卻沒有完全得逞。至於幾十年後的基督教在華夏大地上流傳，仍然是因為國人沒有刻骨銘心的信仰，閑下來心裏無聊的人，用來自己做心理安慰而已。
朱有孝的想法就是如何讓大明在四麵出擊的時候，能夠有一個良好的借口，不讓軍人有一種負罪感，認為這是在拯救對方，這還必須要從儒家和道家的經典裏找到根據，這可是一個龐大的工程，需要幾代人的努力，但是現在必須有一個最原始的借口，哪怕以後在加以圓滿也行，究竟該從那裏尋找突破口呢？
普天之下，莫非王土；率土之濱，莫非王臣。君權神授，天人合一與天人感應，實現大一統格局，宣揚天命，但懷疑鬼神，子不語怪力亂神，這是儒家的思想之一。道教以《道德經》的思想為主要教義，倡導尊道貴德、重生貴和、抱樸守真、清靜無為、慈儉不爭和性命雙修。道教認為，無形無象的“道”生育了天地萬物。道散則為氣，聚則為神。神仙既是道的化身，又是得道的楷模。故道教徒既信大道，又拜神仙。擁有龐大的神團係統。如三官、四禦、四值功曹、六丁六甲、三十六天罡、七十二地煞、玉皇大帝、王母娘娘、真武大帝、東嶽大帝、碧霞元君、鬥姥元君、驪山老母、關聖帝君、城隍、土地、灶君、門神等等。