騰訊研究院建立以後，公司首席技術官的熊明華說：“目前，中國互聯網的研究主要集中在應用領域，它導致的直接後果是我們互聯網對於基礎和計算技術的掌控不足。從全球範圍來看，這樣的短板，將使中國互聯網處於被動的跟隨者之列，因此騰訊研究院將研發重點放在互聯網基礎技術上，通過自主創新的模式提高中國互聯網的基礎技術。此外，研究院的成立也將從機製上縮短技術普及用戶的時間，使客戶享受到技術創新帶來的更優質的服務。”
騰訊研究院成立以後，為了研究院能快速、長期發展，馬化騰製定了研究院的文化。研究院的文化主要有四個方麵：第一，合作，研究院文化強調研究院團隊合作和研究院與高校之間的合作；第二，創新，強調技術和產品應用的創新；第三，實用，強調研究實用的基礎技術；第四，研究，強調學習、探索的科研精神。
2008年，四川汶川發生大地震，造成了毀滅性損害。地震過後，舉國同心，為汶川捐款捐物。騰訊經過內部討論，決定在成都市高新區投資5．5億元，建立騰訊成都研發中心、信息中心和客服中心。2009年4月，研發中心第一期工程已經建成投入使用。
當媒體問馬化騰為什麼將新的研究中心建立在成都時，馬化騰表示：騰訊對四川的信心持續不變，成都未來將成為騰訊在西南地區發展的樞紐城市。
馬化騰將騰訊研究所的創新之路分成三個階段，從建立到2004年是學習型創新階段；2004～2006年是整合型創新階段；2006年以後，經過上述兩個階段的創新，騰訊將進入戰略性創新階段。騰訊研究院的完整體係正在馬化騰的領導下建立起來，相信不久的將來，騰訊會徹底摘掉“抄襲大王”的帽子。
騰訊的創新實例
中國經濟學家熊彼得曾經給創新下了一條定義：所謂創新就是創造性的破壞。簡單點說，就是破壞一個舊世界，建設一個新世界。
創新是破壞和建設同時進行的過程，所以創新者往往要承受巨大的壓力。當年，斯蒂芬森發明火車的時候，很多人嘲笑他的龐然大物居然跑不過馬車。可以想象心高氣傲的史蒂文森所處的窘境，而這幾乎是所有創新者必然麵對的情況。可以說，創新之難，難於上青天。
網絡經濟和創新關係極為緊密，網絡經濟本身就是創新經濟。從計算機的發明到計算機的普及，再到互聯網的廣泛應用，網絡經濟的發展伴隨著人類智力的巨大創新。比爾·蓋茨甚至認為，資本主義要靠創新來提高生產力，緩和社會矛盾。
中國互聯網行業發展到現在，已經過去了二三十年，在此期間，先行者們對創新有著深刻的體驗。網易創始人丁磊是典型的互聯網創新者，他說：“我覺得創新是非常危險的事情，網易發展到今天，我很害怕創新。我覺得創新的風險非常大，尤其對於新公司而言，一不小心創新就把一家公司搞死了。”
創新的風險真的如此之大？丁磊說：“首先，創新需要很多錢。其次，創新的東西需要客戶有一個逐步認識的過程。再次，如果客戶不接受創新的產品，就要重新調整，克服很多技術難題。無論從哪方麵講，創新都是對一個公司的財務狀況的一次挑戰，所以說創新非常難。”
企業創新之所以難，最重要的原因是企業麵臨著生存的壓力。一個創新項目不成功，企業就可能走向衰落。日本著名企業索尼公司，最初靠著隨身聽和電視機這兩項創新走上了一條快速發展的道路。到了20世紀80年代，索尼對液晶平板電視等新技術估計不足，研製出一批沒有市場推廣價值的產品，最終導致公司巨額虧損。
丁磊在創業過程中，也曾經麵臨過創新產品市場反應平淡的情況，所以他說：“如果你想創新的話，首先要把別人的東西研究透了，你才能去創新。我們現在製定營銷戰略的時候，都是首先看我們的競爭對手在做什麼，他們做完了，我們把他們的問題找出來，這樣我們就可以少犯錯誤。”
在中國的企業家中，和丁磊持有同樣看法的人很多，華為總裁任正非就是其中一個。在華為的發展過程中，有很多例子表明隨意的創新非常危險。例如，華為曾經生產過一批準備銷往歐洲的電信設備，公司某個工程師對設備進行了創新微調，卻不料導致這批設備進入歐洲市場血本無歸。吃到創新苦頭的華為，此後設置了硬性規定：創新項目必須使用80%以上的既有專利，創新必須吃透前人的思想。