任期過半，處處碰壁，艱辛備嚐；變革之心不改，後半段成為成敗關鍵。
2010年5月20日，馬英九執政整兩年。
5月19日，馬英九召開執政兩周年記者會，以“大步向前，開創黃金十年”為題，向島內人民做出“期中總結”，其中，有施政成果，有未來願景，也有對這兩年施政的檢討。從馬英九體貌上的變化，人們可以看出他在這兩年中的操勞，以及遭遇的艱辛。龍應台女士曾慨歎：“可憐的馬英九！”這是一個識馬者內心深處對他感同身受般的痛惜。為什麼 “可憐”？因為他有理想，而理想與現實的差距太遠，不論這種差距原因何在，他至今仍在民望的低穀區堅持著自己的方向和目標。
方向一：
兩岸與對外關係的“良性循環”
完成對“台獨”執政的撥亂反正，讓兩岸與對外關係呈現“良性循環”，是馬英九為自己任期定下的兩岸與對外關係上的方向和目標，也是馬英九在兩周年記者會上所謂 “和平護國”的願景。
李登輝、陳水扁近20年“台獨”執政結果是：兩岸不和平、經濟大衰落、國際不買賬，台灣政治、“外交”、經濟利益全麵陷入危機與邊緣化。這使得長期以來國民黨在台灣打下的基業，那些始終被視為優於大陸、可抗衡大陸的政治、經濟籌碼快速流失，而與此同時大陸的國力迅速崛起，兩岸優劣態勢逆轉，作為“中華民國”的忠實捍衛者，馬英九既不甘心也很著急。因此，他要力爭八年任期，並利用這八年完成對“台獨”執政的撥亂反正，達成兩岸與對外關係的“良性循環”，重振台灣失去的競爭力。
對馬英九來說，兩岸關係的終點在哪裏不是他要解決的問題，他也難以解決，他能肯定的就是兩岸關係是台灣所有問題的症結，因此，政治、經濟、“外交”困境，都要從兩岸關係正常化來著手化解。為此，他營造兩岸和平環境，維持“在《中華民國憲法》架構下的‘不統、不獨、不武’”狀態，並在“九二共識”基礎上推動兩岸交流與合作。他認為，“兩岸關係改善有益國際關係拓展，而國際關係的拓展，又會讓台灣對深化兩岸關係更有意願及信心”，這就是“良性循環”。
在這樣的“良性循環”下，台灣與大陸實現“大三通”，開放陸客觀光，擴大並深化各方麵的交流，簽訂ECFA等經貿協議，在兩岸“外交休兵”下進行“正常外交”，穩固“邦交”，恢複台美互信，並擴大國際活動空間，等等，就成為馬英九施政的主要目標。
方向二：
建構新的島內政治文化模式
以八年任期奠定新的政治文化模式，是馬英九的另一個執政方向。馬英九在兩周年記者會上所謂 “文化興國”的願景，就隸屬於這個方向。“以文化發揚台灣優勢，讓台灣特色文化軟實力感動世界”，是這一願景的基本內容。台灣的“優勢文化”在哪裏？就是馬英九所謂的“民主政治”。但台灣民主政治的惡質形象屢屢通過媒體散播出去。
李登輝、陳水扁執政近20年，給台灣社會留下諸多負麵的政治文化“資產”，其一就是李登輝時期的黑金政治。黑金政治源於國民黨屈從或利用地方派係以鞏固執政根基，由此衍生派係政治。地方派係運用金錢與暴力影響選舉，惡質選舉又導致形成“立院”功能不彰，民主體質不良，政治風氣頹敗的惡性循環，也讓國民黨付出失去政權的代價。對國民黨而言，改革派係政治的惡劣風氣，讓台灣徹底告別黑金政治，是非做不可的改革。
其二是陳水扁時期將政治掛帥發揮到極致，對司法權肆意幹擾，在法律上奸詐取巧、雙重標準，在選舉議題的操控上更是不擇手段至無法無天的境地，民眾被肆意操弄欺騙。這些政治人物玩權弄法，不擇手段，不顧民生，進一步扭曲了公平正義、公道是非等道德倫理基本價值觀念。
馬英九對島內政治文化的重新建構，就從上述兩個層次著手。馬英九對國民黨黑金政治、官僚腐化、派係傾軋極不認同，因為馬英九的政治文化與國民黨政治文化大異其趣。馬英九的政治文化，原則上講求清廉自律，不搞派係、沒有人情包袱，沒有利益交換，一切依法依程序辦理，而國民黨內目前仍盛行私相授受、利益交換、“喬”事情的政治文化習氣，這樣的黨當然不能完全配合馬英九的施政步調，也正因此，馬英九曆來高舉國民黨改革的大旗。早在“法務部長”任內，馬英九就大刀闊斧地掃除黑金，並因此而得罪了地方派係和李登輝，最終黯然離職。而2005年與王金平競逐國民黨主席，馬英九的勝出，實際上正凸顯了基層黨員對國民黨老舊政治文化的不滿，以及對國民黨改革的高度期待。可以說，馬英九的政治文化與運作模式與馬英九的施政必然是一體兩麵，如影隨行。以新的政治文化建構新的政治運作機製，是馬英九順利推動政務，保證執政正當性的政治基礎。此外，“廉政風紀、守憲不濫權、中道不操弄”，“堅持領導正派、幹淨政府”，必然是馬英九整頓吏治、重建政治道德的目標。