4月28日，天津萬興房地產公司與日本微笑堂（香港）有限公司簽約成立天津萬笑飯店有限公司，注冊資本1500萬美元，雙方各占50％的股權。
5月，萬科東北經營管理本部成立，統管東北地區房地產項目，標誌著總部對外地公司的業務管理逐步走向成熟化與規範化。
5月，集團控股公司沈陽萬眾股份有限公司參股錦州港，並派出管理人員對其進行改組，輸入現代企業經營管理機製，以少量資金激活存量，使錦州港當年贏利大幅上升，被政府及媒介稱為“萬科模式”，成為改造國有大中型企業的成功範例。
8月，集團頒布《職員職務行為準則》，成立監察委員會，負責內部監察工作，並在集團內深入開展反腐倡廉活動，要求員工恪守職業道德，同時嚴格相關製度，防患於未然。
9月23日，青島銀都花園竣工。該項目為集團第一個全麵竣工的大規模住宅區。青島銀都花園的開發成功，為萬科以合資方式開發房地產提供了寶貴經驗。
9月，萬科投資拍攝的影片《蘭陵王》在上海舉行首映，並開始在國內發行。《蘭陵王》獲得多個國際電影節的參展邀請，在美國SANTA CLARITA電影節上獲最佳外語片獎，在夏威夷電影節上獲最佳攝影獎。
10月9日，公司召開第二屆特別股東會議，通過了關於修訂“職員持股計劃”期權行使價和對章程及細則作相應修改的議案。職員持股計劃第一階段期權全部行使後，公司股本最多將增加900萬股，占總股本的3.2％。行使後之普通股將申請於1996年起上市流通。
11月，深圳天景花園、青島銀都花園被評為“全國物業管理優秀住宅示範小區”。
1997年
上半年，集團順利實施配股計劃，共募集資金3.83億元人民幣，用於深圳房地產項目開發及土地儲備，配股資金的到位為集團重點投資深圳房地產市場的經營決策提供了有力的資金支持。
7—9月，王石第一次休長假，曆經青海、西藏、四川以及雲南等省。
10月，集團協議轉讓下屬的兩個工業項目——深圳萬科工業揚聲器製造廠和深圳萬科供電服務公司，至此，集團基本完成對非核心業務的調整。
11月，鑒於萬佳百貨經營規模及利潤回報的穩定增長，以及集團對深圳零售業務市場前景的樂觀判斷，董事會決議增持萬佳百貨股份由60%至68%。
年內，集團總部實施電腦化辦公管理，並開通和全國各分公司的電子郵件等溝通渠道，提高了管理效率。
1998年
1月，王石受到國務院副總理朱鎔基接見，朱鎔基對王石有關房地產市場走勢和發展的看法給予充分肯定。
4月，董事會決議減持銀都置業有限公司股權及增持深圳海神置業有限公司股權，完成對房地產投資的地域調整。
11月，集團正式委托香港美聯物業代理萬科俊園並在香港舉辦展銷會，標誌著萬科地產開始利用市場資源拓展新的銷售網絡。
11月，董事會決議轉讓集團下屬的廣告公司——深圳國際企業服務公司，完成業務架構的調整。
12月，王石入選中央電視台為紀念改革開放20年拍攝的大型電視人物傳記片——《20年20人》。
1999年
2月，鑒於集團業務架構調整的完成和職業經理隊伍的成熟，董事會決議接受董事長王石辭去公司總經理職務的辭呈，並聘任姚牧民為總經理，同時聘任鬱亮為公司常務副總經理兼財務負責人。
4月，王石參加世界經濟論壇——'99中國企業高峰會，並代表中國房地產界在論壇上做專題發言。
5月，王石參加由中國房地產業協會主辦的'99中國住房發展論壇，在論壇上第一次提出“城市空心化”概念。
7月，為進一步提高萬科地產開發水平，豐富萬科品牌內涵，增加項目開發科技含量，公司董事會決定成立萬科建築研究中心。