（二）實行會計電算化可以加強資金管理、防止腐敗
傳統的會計工作都是手工做賬，人為因素較多，往往會使資金管理混亂，容易造成基層經濟的腐敗。在我國很多農村集體資金的使用並不是很合規，有的村幹部甚至會指使財務人員巧立名目以騙取農村集體資金，進行貪汙腐敗，使得集體資產大量流失。在農村會計核算中推行會計電算化，會計軟件就會很好地控製這一問題，對有關費用會進行自動控製，提示應收應付往來賬目的時間和金額，從而避免農村集體資金的沉澱和流失，加強對集體資金的管理，規範化基層領導和財務人員的經濟行為。
（三）實行會計電算化可以促進村級財務公開
農業部曾發出通知《關於進一步加強農村集體經濟組織財務公開和財務核算工作的通知》（農經發[2004]8號），要求農村集體經濟組織必須實行財務公開製度，並且要做到“經常化、製度化、規範化”。但是有些農村並沒有很好地實施，所謂的財務公開很多隻是一個形式，並沒有正在去公開有用的信息，不公開的情況也時有發生。在村級財務核算中實行會計電算化，財務公開表會由會計軟件自動生成，公布時間、方式、內容、程序都會進行統一管理，提高了科學性，減少了人為性，使得公開內容更準確，格式更規範，村級財務公開的透明度和可信度也得到了較大的提高。
（四）實行會計電算化可以精簡機構和人員
村級財務核算實行會計電算化，會使得會計工作更加科學有效，可以減少會計機構和人員的浪費。會計電算化為精簡機構和人員提供了有力保障，在實行會計電算化後原來需要多人完成的工作，現在可能隻需要幾個人就可以完成了，大部分的工作可以由計算機去完成。將會計電算化和會計委派製有機結合，還可以改變各個鄉（鎮）原有的需要專門成立農業經濟管理站或農村會計代理機構等部門來進行村級財務核算的模式，從而精簡了機構和人員。
五、新農村建設財務核算實行會計電算化存在的問題
（一）思想認識上存在誤區
在我國的農村工作中，有很多的農村負責人並不了解會計電算化，實施會計電算化的目的以及對農村經濟發展的影響，思想認識上存在不足。另一方麵，某些農村負責人還會認為農村勞動力多，推行會計電算化會使村級會計人員出現冗餘，就有可能被解聘，而這人中不乏農村經濟發展中的有功之臣，為了他們不會失業，所以就從思想上不讚成實行會計電算化。在一些貧困地區的基層農村中會出現對於會計電算化 “領導覺得沒必要，會計心裏不想要”的局麵。這種思想認識阻礙了村級財務核算會計電算化的全麵推行。
（二）資金投入不足，財務軟件難求
會計電算化雖然已發展多年，但由於市場經濟的作用，其軟件的發展一般是“重商輕農”，市場上的大多數會計軟件都是麵對各種企業的，適合農村使用的會計軟件較少，就算有幾款，其開發的也不會很完善，難以滿足現實需要。財務軟件的缺乏必然會影響村級財務核算會計電算化的推行。另一方麵，在財政資金上也存在不足，實行分稅製以來，財權有不斷上移的趨勢，基層單位可供支配的資金越來越少，在一些農村，特別是國家級貧困縣多的省份根本不具備推行會計電算化所需要的資金，沒有一定的硬件和軟件設施，會計電算化的推行必然會受到很大的影響。
（三）缺乏合適的村級會計核算人員
現有的村級財務核算的會計人員主要是自主選任和委托代理兩種模式，自主選任的會計由於選任的人選較少，層次不夠，往往存在文化水平不高，接受新生事物的能力較弱，麵對計算機和信息化技術知之甚少。代理會計雖然熟悉會計實務，但對會計信息技術的掌握也存在不足。推行會計電算化要求會計人員除了懂會計方麵的知識還需要掌握計算機等現代的信息技術，代理會計如果沒有專門的培訓，也不能適應工作，缺乏合適的會計人員在很大程度上阻礙了村級財務核算會計電算化的推行。