(3)有許多項目，如新產品開發支出和廣告支出，從理論上看是資本支出，但發生時立即作為當期費用。
(4)有些項目是估計的，如無形資產攤銷和開辦費攤銷，但這種估計未必正確。
(5)發生了非常的或偶然的事項，如財產盤盈或壞賬損失，可能扭曲本期的淨收益，使之無法反映盈利的正常水平。
第二，會計信息的有效性問題。會計報表中反映的數據是企業過去會計事項影響的結果。根據這些曆史數據計算得到的財務比率，能否完全有效地推知未來，作為企業預測、決策的有用信息，顯然還存有疑問。而且，比率分析法本身隻是就經營狀況與財務狀況進行比較分析，忽略了企業的各種資源(如管理資源、人力資源、社區資源等)的利用方麵，而企業的盈利能力和財務狀況恰恰都要受企業決策者如何取得並運用資源的影響。因此，隻有分析企業資源的利用，才能更有效地評價企業的管理效能。
第三，尤其是在跨國企業作比較分析時，東道國會計準則不同，其報表的讀解分析也各不相同，它們的財務比率沒有可比性。例如，由於各國準則對待審慎原則執行程度不同，因此最終報告利潤的保守程度大不一樣。美國企業的保守程度為100%，英國為125%，德國為87%，而日本為66%。因此，對各國企業利潤指數要進行調整。為什麼在日本，認為合理的市盈率一般可達60～70%，而在美國則為10～20%，其原因之一即在此。
綜上所述，比率分析法存在著一些缺憾，財務分析不能完全依賴於比率分析。因此，頂級企業普遍采用綜合財務分析方法。
第三節 綜合財務分析法運用
前文所述比率分析，均是對單一指標的分析，這隻能反映企業某方麵的財務狀況或經營成果，不能全麵地評價企業的財務狀況和經營績效。為全麵地評價企業的財務狀況和經營成果，必須把企業各項財務指標視為相互聯係的係統，進行綜合財務分析。綜合財務分析就是對企業的綜合財務狀況包括企業的償債能力、營運能力和盈利能力進行分析。進行綜合的財務分析的方法主要有杜邦分析法、沃爾評分法和雷達圖分析法。
一、杜邦分析法
1杜邦分析法原理
杜邦分析法就是利用各主要財務比率指標間的內在聯係，來綜合分析企業財務狀況的方法。 企業的各項財務活動、各項財務指標是相互聯係的，並且相互影響，它們構成了一個完整的財務係統。杜邦分析法就是利用各個主要財務比率指標之間的內在聯係，來綜合分析企業財務狀況的方法。該方法是由美國杜邦公司創立並最先采用的。
2分析途徑
運用杜邦分析法時，可以從以下幾個方麵進行分析：
(1)權益收益率
權益收益率是綜合性最強的財務比率，是杜邦分析體係的核心內容。它代表了所有者投入資金的獲利能力，反映企業籌資、投資、資產運營等活動的效率。提高權益收益率是所有者財富最大化的基本保證。這一比率的高低不僅取決於總資產收益率，而且還取決於股東權益在總權益中的比重。
(2)總資產周轉率
總資產周轉率也是一個重要的財務比率，是企業銷售利潤率與資產利潤率的綜合表現。銷售利潤率反映了銷售收入與其利潤的關係，要提高銷售利潤率，不僅要增加銷售收入，而且應努力降低各項成本。要提高總資產周轉率，一方麵要增加銷售收入，另一方麵應降低資金的占用。企業可以通過對流動資產周轉率、應收賬款周轉率、存貨周轉率等各類資產使用效率的分析，來判斷影響企業資產周轉的主要問題有哪些，據此加以解決。
(3)銷售利潤率
銷售利潤率反映了企業稅後淨利潤與企業銷售收入的關係，提高銷售利潤率是提高企業盈利能力的關鍵。而提高銷售利潤，一要靠提高銷售收入，二要靠降低成本費用。降低各項成本開支也是企業財務管理的一項重要內容。通過各項成本的列示，有利於進行成本、費用的結構分析，加強成本控製。
(4)資產利潤率
在資產營運方麵，要聯係銷售收入分析企業的資產的使用是否合理，流動資產與非流動資產的比例安排是否恰當，其比例結構是否直接影響資金的周轉速度。一般而言，固定資產直接體現了企業的經營規模、發展潛力，流動資產直接體現了企業的償債能力和變現能力，兩者之間要有一個合理的比率關係。如果某一項資產比重過大，就應深入分析其原因。