現階段中國糧食物流對糧食安全的影響，主要表現在三個方麵：一是對糧食綜合生產能力的影響；二是對糧食有效供給和儲備規模的影響；三是對糧食市場價格的影響。中國糧食工作的實踐經驗表明，建立現代糧食物流體係，是保障國家糧食安全的基礎工作之一，是未來幾十年裏，中國經濟持續快速發展所需優先解決的重要問題。糧食生產能力固然重要，但隨著中國優勢農產品區域分工日益明顯，農村人口逐漸向城鎮轉移，以及糧食消費結構發生變化，預計未來中國糧食物流量將明顯增加，流通瓶頸問題更加突出。糧食市場近幾年因物流製約，引起部分地區、部分品種的供求失衡影響放大，已經說明建立現代糧食物流體係對保障國家糧食安全的重要意義。由於人們一般對糧食安全的認識還停留在總量平衡的層次，而對糧食物流與糧食安全的關係認識不夠，所以，實現中國糧食物流現代化，是一項十分艱巨的任務。
根據中國國情的特殊性，糧食物流在糧食安全體係中具有不可忽視的地位。糧食生產結構調整和建立現代糧食物流體係是目前中國糧食安全所麵對的兩大現實問題。糧食生產結構調整，需要現代糧食物流體係作為保證條件。現代糧食物流體係的建立，可以有效地促進糧食生產結構調整，促進糧食生產能力擴大。同時，物流業的進步可以提高糧食供給保障水平，降低儲備成本。糧食流通效率提高，會使具有百價之基的糧食市場價格穩定在合理區間，從而促進國民經濟持續穩定發展。
（一）中國糧食物流能力對糧食綜合生產能力的影響
糧食綜合生產能力是國家糧食安全的基礎，主要包括生產數量保證和產品質量優化，糧食物流正是在這兩個方麵製約糧食綜合生產能力。
1.糧食物流能力提高，可以促進糧食產區生產規模擴大
糧食物流量與糧食產量有直接的關係，與糧食生產能力存在間接關係。糧食生產能力還不能代表糧食產量，而是決定糧食產量的主要因素之一。它與氣候條件、水資源、科技發展、生產者投入以及糧食市場價格和政府幹預等因素共同決定糧食產量。糧食產量在保證產區消費後，可以調出的部分形成跨省糧食物流量。當糧食產區可以調出糧食數量隨生產發展而擴大時，物流能力就對生產能力形成製約。中國目前正處於這樣一個階段。
在過去十幾年中，中國糧食市場出現兩次比較大的波動，都與糧食物流能力較弱有關。回顧1994-1995年和2003-2004年中國糧食市場波動情況，從總供給與總需求看，糧食市場並沒有發展到嚴重失衡狀況。但總量供大於求，並不等於所有需要糧食的地區都能及時得到所必需的糧食數量。這說明糧食的總量問題解決後，還需要高效地將糧食運抵所有需要的地方，才算實現了糧食安全。物流是溝通產銷的關鍵一環，物流不暢，會出現產區賣糧難，銷區買糧難，就可能出現糧食南進北出的局麵。產區賣糧難，會影響農民對下一年度種糧的投入，使糧食生產發展受到製約。銷區買糧難，會引起價格波動，從而引發連鎖反應，引起市場不必要的波動。
目前中國糧食市場已經形成北糧南運的格局，中國東北糧食主產區作為增產潛力較大的地區，糧食物流能力對生產製約尤其明顯。東北4省區農業資源和工業資源均比較豐富，需要通過物流渠道運出的產品數量巨大，而物流通道運輸能力有限，這是北糧南運首當其衝的問題之一。促進北糧南運物流通道建設，就是促進糧食主產區糧食繼續增產。如果隻是單純對主產區種糧農民進行補貼，而忽視物流設施的規劃和建設，就將使生產出的商品不能實現或不能完全實現其應有的價值，從而製約糧食產區生產的持續發展，製約糧食生產能力的提高。中國黑龍江省是粳稻主產區，近幾年當市場粳稻價格較高、供不應求時，黑龍江省卻出現較大數量的陳化糧。運力不足、流通不暢是除政策因素外，引起東北地區陳化糧偏多的首要因素。目前黑龍江一省陳化糧約占全國的82%，需要至少一年才能處理完，損失較大。要使中國東北地區糧食生產能力得到充分發揮，需要對東北糧食外運物流通道規劃建設給予足夠重視。
加入世貿組織後，中國糧食生產受到國際競爭的壓力，發達國家采取現代化、規模化糧食生產方式，成本低、效益高，迫使中國糧食主產區生產也必須擴大規模、調整結構、降低成本。否則，隨著勞動力成本優勢逐步降低，中國糧食生產的國際競爭力將越來越差，成為發達國家剩餘農產品的衝擊對象。
在“十一五”期間，中國糧食生產預計將以1%的速度增長，隻有保持這樣的增速，才能滿足需求。糧食主產區是產量增加的主要地區，而預計中國多數銷區產量將會穩定或有所減少。這將促使產銷區進一步分化。2004年中國糧食跨省物流量已達11000萬噸，根據過去10年糧食物流年度平均增長速度推算，“十一五”期間，糧食物流量將以每年5%以上的速度增長。物流對糧食生產能力的製約日益明顯。
2.糧食物流能力製約區域糧食生產專業化發展
糧食物流對區域糧食生產的專業化和產業結構調整影響很大。中國農村人口眾多，農業生產規模較小，這是中國的基本國情之一。隨著社會經濟發展，糧食生產技術進步，機械化、電氣化水平提高，專業化糧食生產規模將會逐步擴大。2006年中國人均耕地麵積隻有1.39畝，但實際上農村勞動力有很多已經不從事糧食生產，在一些主產區，糧食種植大戶所耕種的土地已經具有一定規模。糧食生產規模大小直接關係到種糧成本和效益，在市場經濟環境下，優勝劣汰和優勢區域分工、規模化生產將是農業發展的必由之路。要實現這種良性發展目標，關鍵在於物流業的發展能否適應生產需要，現代物流可以促進糧食專業化生產；而比較緊張的物流條件，將限製一個地區糧食生產專業化和規模化發展。
糧食優勢產區發展糧食生產，一般都會側重一些優質品種，優勢產區並不是所有糧食品種都具有生產優勢。專業化生產，將會形成一個地區單一糧食品種產量較大。區域分工所產生的是整體效益最大化，優勢產區拋棄了種植劣勢產品，與其他產區形成優勢互補，優勢是講生產，互補則是流通。正是由流通使優勢得以發揮，劣勢得以互補。優勢產區生產可能是單一的，但優勢產區的消費並不是單一的。因此，糧食物流在今後相當長時期內，將是中國糧食區域優勢發展的主要製約因素之一。
現代化成規模的糧食物流設施體係能快速調運糧食，從而促進一個地區的專業化生產。隨著經濟快速發展，中國公共物流條件雖然已經有較大提高，但與發達國家相比，差距明顯。從物流基礎設施看，美國公路是中國的3.7倍，鐵路是中國的4倍。中國糧食運輸條件無法與美國相比，但糧食物流量卻與美國基本相同。