一 行政機構
1949年，四十七團衛生隊成立，歸屬團後勤處領導。它的主要任務是負責戰地救護，且兼管營衛生所。1953年，衛生隊隨部隊轉業，屬十三團司令部領導，為行政、醫療、防疫三者合一機構。1957～2001年，團場隸屬關係幾經變動，但醫院始終直屬紅星二場領導。
1985年，成立農場衛生防疫站，與醫院統屬農場領導。防疫站設專職副站長一名，負責防疫站行政和全場防疫工作。財務由醫院統一管理，醫院設黨支部書記1人，院長1人，分別管理醫院的政治思想、醫療、財務以及醫務人員的調配與後勤工作。
二 醫療機構
（一）職工醫院
1950年，四十七團衛生隊隨團進駐新疆哈密，全團有衛生人員30餘人。邵宗仁任隊長，張承忠任副隊長，李蒼龍任指導員，醫生是王泉、王炳文和安承恩，醫助人員是胡秀荷、黃殿元、劉發生，司藥是侯水旺，還有調劑員、護士、文教人員和司務長等。自剿匪回哈密後，有了固定的住所，地址在哈密縣老城，設立了病房、外科室、門診室，建立了護士辦公室和值班室，醫生也做了明確分工，輪流坐診。1952年，衛生隊從哈密老城遷到哈密二堡鄉八大隊。1954年遷到火石泉場部，衛生隊有10張病床，兩間病房。到1966年，已有39張病床，12間病房，職工31人，醫院增設了放射室，有1名放射科醫生。1977年，衛生隊改為哈密地區紅星二場醫院。李俊超任副院長，張慶元任政治指導員兼書記。醫院職工增加到40人，設床位42張，醫院增設中醫科、手術室。
1983年，醫院又改稱為“兵團哈管局紅星二場職工醫院”。這時醫院分設門診和病房。新設口腔科和理療室，一台200毫安X線診斷機，使用率75%。病人住院條件得到改善，新購折疊病床4張，普通鋼絲床8張。
1986年，醫院有職工55人，衛生技術人員49人，設床位50張，利用率54%，年床位周轉次數為13.4次，除原有科室外，增設了醫院辦公室和心電圖室。
1992年，醫院有職工45人，設內科、外科、兒科、婦產科、五官科、中醫科、檢驗科、功能室、藥劑科，增設傳染科。新購進綜合產床一張，生化分析儀和洗胃機各1台。
1995年，農場自力更生，籌資80萬元，修建了1240平方米的醫院門診樓。醫院增設計劃生育服務站和針灸按摩室。
1996年10月27日，紅星二場醫院以93分的優秀成績，順利通過了兵團哈管局“一甲醫院”的評審，成為哈管局首批獲得“一甲醫院”稱號的職工醫院。
1997年10月，醫院通過國家評審，獲得中華人民共和國衛生部、聯合國兒童基金會、世界衛生組織授予的“愛嬰醫院”稱號。
2001年，全院有職工57人，衛生技術人員50人，院長王維新，書記張炳祿，均為副主任醫師。醫院占地麵積9200平方米，建築麵積為2280平方米，住院部設床位40張。全院共設20個科室，分別為內科、外科、兒科、婦產科、五官科、口腔科、傳染科、中醫科、放射科、檢驗科、藥劑科及B超室、心電圖室、理療室、換藥室、急診室、待產室、手術室、針灸按摩室和計劃生育服務站。
（二）衛生室
1949年，四十七團在下屬的三個營設有衛生所，配有醫生、調劑各1名。各連隊有1名衛生員。1950～1953年，連隊衛生員先後有李文成、冷成久、林騰、蘆巧生、薑銀才、陳依全、郭行建、柳岱姍、何生祿、張世劍、王貴明、曾倫、陳誌武、趙彥秀、孔慶南。1954年，撤銷營衛生所，營衛生人員調到團衛生隊。衛生隊醫生輪流到連隊巡診，配合連隊衛生員工作。1960年，農場連隊有7個衛生室，各配1名衛生員，後隨單位變化而調整。
1971年，場設有12個衛生室。各有1名衛生員，三連設衛生所，1名醫生，2名衛生員。