元朝時，今北京地區終於成為統轄大江南北的統一的封建國家的首都，並第一次成為全國的交通中心。由於建立元王朝的蒙古族雖然占領了以漢族人為主的中原和江南地區，但其仍然生活在草原上的部分始終勢力強大，並成為以大都(今北京市)為首都的元朝政權的堅強後盾。這樣，地處中原地區與蒙古高原交界處的今北京地區，其交通樞紐作用更加突出。另外，由於元朝統治者非常重視驛站的作用，所以這一時期的驛道建設又達到了一個新的高潮。
（第一節）今北京地區元朝時期的行政區劃
元朝時，今北京地區屬於大都路。元朝初期，大都路轄區幾經變化，直到仁宗(1312-1320年在位)以後終於確定下來，此後未再有大的變動。
一、忽必烈定都北京
1206年，成吉思汗鐵木真建立蒙古國政權。1211年，蒙古軍隊開始大舉伐金。兩年之後，蒙古軍兵分三路南下，1215年攻陷金中都城(今北京城區西南)，改名燕京。當蒙古騎兵攻陷中都城的時候，蒙古貴族集團還絲毫沒有在這裏建立都城的打算。於是，在兵荒馬亂之中，中都城內金朝的皇宮被大火焚毀，成為一片廢墟。一直到1260年鐵木真之孫元世祖忽必烈登上汗位時，仍立都於開平(今內蒙古正藍旗東閃電河北岸)，稱為“上都”。世祖至元元年(1264年)，忽必烈雖複將燕京之名改回“中都”之稱，但隻是作為陪都。
至元八年(1271年)，忽必烈定國號為“大元”之後，為了適應元王朝的不斷發展，同時為了加強對漢族地區的統治，於次年(1272年)改中都為“大都”，並遷都於此，終於將統治中心從蒙古草原遷徙到了中原地區。從此，大都成為統一的多民族國家的政治中心。元大都也是當時世界上最為宏偉繁華的城市之一。
二、基本行政區劃
1215年，蒙古軍在攻占金中都城後即設立燕京路及大興府，管理這一地區的軍政事務。
不久，蒙古政權又設立燕京都行省，派遣斷事官多人到燕京，掌管中原各地政事，並兼理燕京地區政務。燕京路及大興府的機構依舊設置，主要掌管這一地區的具體日常政務。忽必烈改燕京為中都後，燕京路也改為中都路，但大興府依舊。忽必烈遷都大都後，中都路又改為大都路。
元朝時，大都路下所領1府和13州，其中7個州或部分、或全部在今北京市轄區以內。
1府即大興府，其轄6縣中有4縣在今北京市境內。它們是大興縣(治大都麗正門以東地區，位在今北京市東部)、宛平縣(治大都麗正門以西地區，位在今北京市西部)、良鄉縣(位在今北京市房山區境內)、昌平縣(位在今北京市昌平區境內)。另外，涿州(治今河北省涿州市)下轄之房山縣在今北京市境內，位在今房山區境內；通州(治今北京市通州區)所轄之潞縣在今北京市境內，位在今通州區境內；薊州(治今天津市薊縣)所轄之平穀縣在今北京市境內，位在今平穀區境內；漷州之州治在今北京市通州區境內；順州之州治在今北京市順義區境內；檀州之州治在今北京市密雲縣境內，其轄區為今懷柔區和密雲縣；龍慶州之州治在今北京市延慶縣境內。
（第二節）元大都城內的交通
元大都並不是在遼、金故城的基礎上興建的，而是在故城城址的東北部，另辟新地，以瓊華島大寧宮為中心而新起的一座都城。據《析津誌輯佚》記載，至元四年(1267年)，忽必烈命令劉秉忠“於燕京東北隅辨方位，設邦建國，以為天下本”。劉秉忠對元大都的總體設計基本上遵循了《周禮·考工記》“匠人營國，方九裏，旁三門，國中九經九緯，經塗九軌。左祖右社，麵朝後市”的規定和《周易》中陰陽八卦的原則，使得大都城建築布局規則整齊，井井有條(見圖31)。正南麵，占據都城主體部位的是皇城和宮苑——即《周禮》中所謂的“麵朝”；正東麵是太廟——即所謂“左祖”；正西麵是社稷壇——即所謂“右社”；在皇城後麵的是鍾樓、鼓樓和中心閣，四周布滿各種市場——即所謂“後市”。
一、外城城門
大都城的平麵設計，呈長方形，其南北略長於東西，南北長7400米，東西長6650米，總麵積達50多平方公裏，實測周長28600米，基本上符合“匠人營國，方九裏”的原則。
大都城從裏到外，由三重建築構成。最裏麵的是宮城，最外一重為外城，在外城與宮城之間是皇城。因為是帝王都城，所以在元大都的平麵規劃設計中，皇城被置於特別顯要的地位，坐落在大都平麵南部的中央，以體現皇帝居天下之正位和南麵而治的理念。
大都外城開有11座城門。東、南、西三麵各3門，北麵隻有兩門。東麵3門自北至南依次名為：光熙門(今和平裏東，明時廢毀)、崇仁門(今東直門立交橋一帶)、齊化門(今朝陽門立交橋一帶)。
西麵3門自北至南依次名為：肅清門(今學院南路西端，俗稱小西門，明時廢毀)、和義門(今西直門立交橋一帶)、平則門(今阜成門立交橋一帶)。
南麵3門自東至西依次名為：文明門(今東單路口南)、麗正門(今天安門南)、順承門(今西單路口南)。