投資基金不是高枕無憂的，因為它畢竟和風險多變的證券市場相連。其主要風險如下。
一市場風險：基金主要投資於證券市場，而證券市場價格會因各種因素而產生波動，從而導致基金收益水平變化，可能造成投資虧損。
一管理風險：基金運作過程中，基金管理人的知識、經驗、判斷、決策、技能、道德以及管理手段和管理技術等因素，會影響基金的收益水平。
流動性風險：由於市場環境或者基金巨額贖回的原因，基金可能不能以當前基金份額淨值進行交易。
基金本身的風險：不同基金品種的風險不一樣，如股票型基金風險要比債券型基金大；相同的基金品種也會因其股票資產投資上限不同而風險不同。
但是，除了以上正常的、無法克服的風險外，人性的貪婪加上監管不嚴等，使得基金還存在另外一些風險。
在2000年，曾經喧囂一時的“基金黑幕”曾讓世人震驚。此前兩年多來（自1998年起）被視作證券市場發展穩定力量的基金，存在嚴重的對倒、倒倉等違規行為。而知名度甚高的《財經》雜誌登載的《基金黑幕》充分展示了股市中坐莊的手法。
2007年5月16日，上投摩根基金經理唐建老鼠倉行為已被中國證監會查實。唐建自擔任基金經理助理起便以其父親和第i人賬戶，先於基金建倉前便買入新疆眾和（上海交易所代碼：600888）的股票，其父的賬戶買入近6萬股，獲利近29萬元，另一賬戶買入20多萬股，獲利120多萬，總共獲利逾150萬元。這即是民間俗稱的“老鼠倉”，也是典型的涉嫌內幕交易刑事犯罪的行為。“老鼠倉”就是指擁有機構資本控製權的人在操控某隻股票之前，挪用公司的資金或者用自己個人（機構負責人、操盤手及其親屬、關係戶）的資金，用個人名義以低價大量買^將要被操縱的上市公司的股票，待用公有資金拉升到高位後個人倉位率先賣出獲利。大多數基金公司也規定，基金經理在取得任職資格時，都要填寫直係親屬、直係親屬的子女的身份證號和股東代碼，投資管理人員的配偶及其未成年子女，不允許買賣股票。但中國目前金融實名製還沒有建立，很多投資人員可以用其他親屬、朋友的名字開戶，所以“老鼠倉”也難以有效根除。
但不管如何，經曆過2000年的“基金黑幕”後，國內基金業對“老鼠倉”等各種違規行為一直十分警惕；而《證券法》中禁止了包括基金在內的證券從業人員買賣股票；200r7年年初證監會基金部專門為此發文，很多內容是針對基金經理“老鼠倉”的監管。相信隨著監管的加強和整體行業道德的提升，此類違法行為會越來越少，基金投資風險也會越來越少。