4.3 PIs耐藥突變 耐藥突變位點有L90M，V82A 基因突變。耐藥突變通過改變蛋白酶底物結合區的結構來減少蛋白酶抑製劑與HIV蛋白酶的結合，蛋白酶抑製劑耐藥突變同時伴有蛋白酶底物的突變，即A431V，L449F，P453L 突變[16]。研究顯示， HIV蛋白酶底物結合域或其遠端位點的氨基酸置換， 都可導致病毒對PIs 耐藥。這些氨基酸的改變直接或間接修改了PIs 與酶接觸位點的數量和性質， 進而降低PIs與酶的親和力[20]。例如V82A 突變降低了HIV 蛋白酶中1個氨基酸殘基的大小，而這個殘基對於結合PIs比結合HIV酶底物更為重要[26]。
接受過抗病毒治療的患者， 不但可能對使用的藥物產生耐藥， 而且對其他藥物亦會產生潛在的交叉耐藥， 因此耐藥性產生對治療的有效性具有很大的影響。即使未經抗病毒治療的患者， 耐藥病毒的感染也會限製初期HAART 的病毒學和免疫學效力。在國外對HAART前進行耐藥分析已作為常規檢測項目， 同時還推薦對HIV急性感染期的患者、病毒學治療失敗的患者以及HIV 感染的孕婦進行耐藥檢測[27]。鑒於全球 HIV 耐藥毒株的廣泛流行，在采用高效抗反轉錄病毒療法的國家和地區，對HIV耐藥性進行流行趨勢監測是一項很緊迫和必要的工作。及時了解和掌握 HIV-1 耐藥突變位點、流行狀況和變化趨勢對於臨床製訂抗 HIV 藥物方案、指導研究和發展新的抗HIV-1策略具有重要的意義。中醫藥著眼於整體，對激活和抑製狀態進行適度調整，盡力使免疫病理性應答向生理性應答轉化，達到調和陰陽的目的，對於提高病人對HAART的耐受性和療效有一定作用，西醫在抗病毒治療的過程中發現，一些曾經運用過中藥的患者HAART耐藥的發生率有所降低，耐藥出現的時間較晚；因此，有必要加強中西藥合用對HAART耐藥的科學研究，提高病人對藥物的耐受性，降低耐藥發生，提高抗病毒治療的成功率，將對降低艾滋病病死率起到積極的作用。
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