三是計劃生育問題。寧夏中南部地區因人口超載而進行生態移民，由於地域原因和民族政策原因，遷出去和遷入區的人口和計劃生育政策有所不同。因此，人口問題是生態移民中的重中之重。超生、孕產婦和育齡婦女的摸底排查等，遷入區和遷出區續接工作繁雜。要在移入區製定新的政策措施，防止超計劃生育的再次複製、反複和延伸。
2.戶籍管理存在著許多即成事實問題
在調研中發現，遷出縣（區）許多移民存在著分灶吃飯，但未辦理戶口分離手續的問題。如彭陽縣孟塬鄉高岔行政村石橋山自然村李繼擴，全家8口人，大兒子結婚生育2個孩子，已分家7年，分灶吃飯。由於大都是文盲，生活意識差，信息不靈，認為耕地、院落和房產分了，分灶吃飯就是兩家人了，並沒有辦理分戶手續。他們麵臨的困難是搬遷後隻按照一個家庭54平方米的統一分配方式入住。目前，在遷出縣（區）待搬遷的移民中還有許多四世同堂的問題存在，分灶吃飯但戶口還沒有分離的家庭普遍存在，他們希望政府深入調研，在事實求是的前提下對症下藥，按既成事實解決戶口問題。
（四）產業發展問題
一是受傳統生產程式的影響缺乏適應環境的能力。由於搬遷到安置地的農業生產方式和消費方式的變化所引起的對勞動力質量要求的變化，原居地和安置地之間的氣候、土壤、水分等存在著明顯的差異，移民在搬遷後原先的生產程式被打破了，在新的自然環境下要形成新的農事生產係統，這種新的農事生產係統對農戶的生產投入、勞動技能的要求都有了更高的要求，由於自身受教育程度、生產技能等方麵的不足而不能適應新環境下的農業生產，導致產業發展受阻。
二是勞動者自身素質較低，適應產業化發展受到了影響。調查中發現，隱藏在移民背後的潛在因素是勞動者自身的文化素質。農業產業化的發展需要有知識、懂技能、善經營、會管理的農村實用人才。但由於農業勞動力的轉移，使很多農民到城市從事第二、三產業，剩下的人對農業新技術如良種、良育等新生產技術很難接受，尤其是經營管理理念欠缺，市場意識、合作意識和法律意識普遍淡漠，不能適應農業產業化發展的需要。
三是農民獲取信息渠道十分有限，導致農民農業生產發展上處於盲目被動狀態。通過調研組入戶調研得知，許多農民家庭為減少次要支出，甚至舍不得多支電費，電視不看、電話不裝、報刊不訂，更無條件上網了解外部經濟發展狀況和市場信息。絕大多數農民獲取信息的途徑多是與別人交談、收聽廣播，所獲信息的渠道大都是文化層次趨同的人，信息相對滯後在很大程度上影響了農民生產、創業思維。信息閉塞，市場行情一無所知，致使農民對農業生產和結構調整、發展經濟處於人雲亦雲、盲目被動狀態，出現雷同投資，重複建設，市場競爭力弱，經濟效益低，甚至無效益現象，嚴重影響了農村經濟發展。因此，著力解決以上問題，使移民產業發展的關鍵所在。
四是受經濟條件的限製缺乏發展產業的主動性。搬遷的農民都是山區的貧困戶，有些家庭極其貧困，他們在交納了建房自籌款，搬遷需要支付的搬遷費用以及在安置地重新安排生產和生活的費用後，幾乎沒有了資金積累，又由於周邊的群眾都是困難群體，融資的能力非常有限，受經濟困難和傳統觀念的影響，在缺資金的情況下也缺乏發展產業的主動性和積極性。
五是生產方式轉變還變需要一個過程。貧困農民搬遷後，農業生產方式發生了根本改變，由原來的牛耕驢馱變為機械化操作，由山地變為川地，由小塊田地變為規模化生產方式，由雨養農業變為灌溉農業，由粗放農業變為精耕細作，由廣種薄收變為集約化經營等等，這些問題的存在嚴重製約著移民後續產業的發展。