陶錫三說：“那些強盜，把所有全部紅木家俱及衣箱，瓷銅器，與一切物品，約值四五千元，被劫一空。唯內有佛堂一間，供奉老祖宗筆畫像，與曆代祖宗神位像，並道院傳授《太乙北極真經》及《午集正經》、《未集經髓》與各種經典，今竟全行被劫。把不能搶走的文物便破壞掉。”
他說：“我從‘自治會’成立以來，經曆了告病離任、多次請辭、和四處逃亡。熊老弟呀！一個人上了年紀的人，在這麼短的時間裏，幾服幾次，終不能逃脫倭寇的魔掌。”
他說：“我的慈善組織‘紅卍字會’是在做賑災濟貧的事啊！是在做戰亂救助的事啊，我的《紅卍檔案》中，掩埋老百姓屍體至今約四萬人，一定保留到審批倭寇的那一天！做一份有力的證據證明他們在南京城犯下的滔天罪行！”
熊東家舉起拇指，道：“保晉大哥好誌氣！”
當時，倭寇為了在南京站住腳，千方百計拚湊和組建維持會、自治會。他們為了利用陶錫三及南京“紅卍字會”的社會影響力，不遺餘力地威逼陶錫三，並多次拉他參與籌備組建工作。
陶錫三幾經推辭，並有聲明在先：“錫三篤信神權，辦理道院紅卍字會曆十有六年，向守會章，不聞政治。”
陶錫三說：“紅卍字會的宗旨：不涉政治、維護和平。”
陶錫三並多次提出：“中國人必須自己管理自己，無須誰來維持”
“維持社會秩序首先要停止殺人。 ”
“紅卍字會職員不能參與政治 ，且南京處在瘟疫蔓延的危機之中，紅卍字會無力參與慈善以外之事務”
在陶錫三一再堅持下，他們終於確定了正副會長的其他人選。
但就在1938年元旦鼓樓市民大會之前，在陶錫三不知情的背景下，突然宣布他為“南京自治會”會長。 陶錫三愕然而無措。
他說：“此次為維持治安，追隨同人之後，本已推舉正副會長。有人乃在領事會集會，時忽被前機關長佐方先生臨時變更，推重錫三，田中領事等從而讚助。雖聲明卍字會職員不能參與政治，固辭不獲，勉暫擔任，以讓賢能，曾經當眾聲明。孰知冥冥之中已受譴責，午夜焦思，百感交集。”
就在這種“突襲” 和“焦思”、“固辭不獲”和“已受譴責”的複雜境遇下，他被推到南京市民大會上宣讀自治會的成立宣言。
鼓樓大會之後，陶錫三為違背道旨和良心的登台之舉，羞辱難忍，舊病複發，1月8號正式告病假而離開自治會。就在他養病期間，倭寇派人手提“生梨”，名為探病，實以“生梨”隱喻“生離死別”相威脅。緊接著又發生了日寇夜襲陶府進行掃蕩，所有貴重物品、古董字畫、敬奉的道祖佛堂神龕、陶氏祖宗牌位均被日寇洗劫一空。
這時候，南京陷入兵荒馬亂的災難之中，陶錫三領導‘紅卍會字’奔忙於連絡各方人士和外國教士弘道展慈，祈求和平。
他擴建救護隊、掩埋隊、難民收容站、臨時診所。
他設粥棚、施棉衣，以“薄棺收掩”死於貧病和戰火中的不幸者，就連被炸死的倭寇飛行員也給與人道收埋。
“紅卍字會”會長陶錫三和他的社會影響力以及精通日語的個人背景，被入侵的倭寇視為非得不可，他們采取欺詐，采取強迫。在軍事占領的同時，野田部隊衝進陶錫三在湯山的“陶廬”溫泉別墅，瘋狂掃蕩、狂飲亂舞之後，立即霸占為倭寇司令部所有。接著便開始軟硬兼施地逼他參與組建偽政權。