這次大撤退一共安全救出5.0662萬人，其中包括皇家空軍人員和數千名塞浦路斯人、巴勒斯坦人、希臘人和南斯拉夫人。這一數字相當於派往希臘部隊人數的80%。從4月21日到撤退結束，英國在德軍空襲中喪失船舶26艘。其中有21艘是希臘的船隻，並且包括5艘醫療救護船。
從此以後，希臘一支規模雖小但頗精悍的海軍歸英國指揮。包括一艘巡洋艦、6艘現代化驅逐艦和4艘潛艇。這支艦隊於4月25日抵達亞曆山大港。
德國征服希臘後，克裏特島便成為希臘國王和政府的最後立足之地。英國也知道德國正虎視眈眈盯著這個島嶼。對英國來說，克裏特島是埃及和馬耳他的一個重要前哨據點。在據守克裏特島問題上，英國戰時內閣沒有意見分歧。4月16日，韋維爾來電稱：“我認為應據守克裏特島。”
英國人知道，戈林一直在努力建立一支能夠進行大規模登陸作戰的強大空降部隊。德國傘兵是一支精銳之師，英國在研究如何防禦德軍進犯本土時，曾考慮過它的作用。克裏特島的情形則不同了，德軍在巴爾幹和愛琴海享有充分而持久的空中優勢。
德軍占領雅典後，德軍參謀人員忘乎所以，不像平時那樣慎於保密，而英國在希臘的諜報人員則十分活躍。在4月末，英國從可靠方麵，得到關於德國人下一行動的情報，德國第11空軍軍團的調動，以及德國人在希臘港口瘋狂搜集小型艦艇的情況，表明德軍即將從海上和空中進攻克裏特島。
4月28日，在倫敦的英國情報委員會，就德軍進攻克裏特島的規模與性質作出了估計，認為德軍同時以空運和海運部隊對該島的行動迫在眉睫。他們認為，德軍在巴爾幹各國可能搜集到315架遠程轟炸機、60架雙引擎戰鬥機、240架俯衝轟炸機和270架單引擎戰鬥機。德軍第一次襲擊時，可能投下傘兵或空降部隊三四千名，而且可能每日從希臘進行兩三次，從羅得島進行三四次，都以戰鬥機掩護。
韋維爾將軍最初並沒有接受英情報人員認為克裏特島是德軍進攻的目標的看法。他認為德國人可能故意傳播謠言，以掩護他們的真正計劃。雖然如此，他還是立即以他素日處理軍務的機動敏捷進行了部署。並親自飛往該島，對克裏特島的防禦進行核查。
4月18日，克島便得到可能德空降部隊進攻的警告，目前除長期駐軍3個步兵營、重型高射炮兩個中隊、輕型高射炮3個中隊和海防炮隊外，至少還有從希臘撤出的士兵3萬人。士氣良好。此外還編成了幾支希臘新部隊，用以保衛機場和看守6000名意大利戰俘。
韋維爾報告說：為了有效駐守克島，至少需要3個旅和相當多的高射炮部隊。現在守軍有3個英國正規營、6個新西蘭營、一個澳大利亞營和兩個希臘混編營。人員裝備不足，沒有大炮，高射炮的規模不大。
5月的第二個星期，德國空軍對克裏特島有效地實行了日間封鎖，它們襲擊來往該島的一切船隻，特別是對惟一設有港口的北岸封鎖得尤其嚴密。在5月頭3個星期，運往該島的重要武器有2.7萬噸，到達該島的還不到3千噸，其餘的物資不得不轉運回來，途中損失了3千噸以上。
德軍進攻克裏特島的計劃，交由第11空軍軍團執行，其中包括第7空軍師和第5山地師，由第6山地師接應，近1.6萬人，大多數是傘兵將空投著陸；另有7000人從海上登陸。共投入作戰飛機1280架，其中“容克52”運輸機530架。
空降部隊的進攻計劃，在3個區域進行：東麵在伊臘克林；中部在雷西姆農、蘇達、幹尼亞；最重要的是西部的馬利姆。發動進攻前的準備行動，是用重達千磅的炸彈，對地麵及防空設施集中轟炸一小時。接著是乘滑翔機或用降落傘著陸的主力部隊從天而降。在德軍的整個作戰概念中，關鍵是把馬利姆機場奪到手。
德軍奪取克裏特島的戰鬥，於5月20日晨開始。在一小時之內，德空軍對機場周圍據點進行了最猛烈的轟炸和掃射，幾乎刹那之間，英軍的大部分高射炮便失去了作用。轟炸停止以前，滑翔機就開始在馬利姆機場西麵著陸。上午8時，德軍便向這一地區空投下一個團，共4個營；下午又投下一個團。在空投時，完全不顧人員的傷亡和飛機的損失。第一天，德軍在馬利姆和幹尼亞之間著陸的德國傘兵共5000餘人。他們在新西蘭軍隊的炮火下，和殊死的肉搏戰中損失慘重。當日入夜前，英軍仍然保有機場。晚間，德軍奪取了馬利姆機場。英軍在雷西姆農和伊臘克林，也受到德空降兵的攻擊，盡管戰鬥慘烈，英軍當天都保住了機場。
到第二天，德軍繼續進攻，馬利姆機場雖然處於英軍大炮和迫擊炮密集炮火下，德國最高統帥部似乎不計損失，至少有100架飛機撞毀在地麵上。但德軍飛機還是不斷飛來。