技能訓練：忍者家族的小孩不論男女，都必須繼承祖先的職業傳統，一般從五歲開始就接受訓練。訓練的種類有五種，即平衡、靈敏、力量、持久及特殊技巧。平衡訓練從走竹竿開始，當能夠在滾圓的竹竿上行走而不滑下，就將竹竿逐漸升高，最終要升到三四十尺高，達到奔跑跳躍如履平地的境界，這樣就能在樹上、屋頂及牆頭上下攀援，行走如飛。靈敏的訓練也是如此跳過插著刀片的繩子，在布滿利刃、槍尖的狹道中拐彎抹角急速穿行。持久及力量的訓練最為艱苦，如雙手掛在樹上，支持全身，下麵放滿暗器，不容你鬆手跳下，以恐懼來激發體內的潛能作長久的支持。長跑更是忍者的基本功，要求連續跑上五十公裏路而不停下來休息，日行百裏是家常便飯。至於特殊技巧訓練就更令人吃驚。除了上述說過的，還有徒手搏鬥，投毒解毒等。化裝術更是忍者的特長，他們能製造人皮假臉，改換性別。讓一個忍者在人群中穿行，由幾個人在一旁辨認，結果各人所見都不相同，高矮胖瘦，不一而足，真可謂“千麵人”。還有隱身術，文章開頭說到美國忍者在煙霧中突然消失就是一種，那是忍者事先挖好一個地洞，然後趁著煙霧掩護跳入地洞，令追捕者失去目標，以為真有“隱身術”（不過一般這樣的洞都是挖在樹林等便於遮掩躲藏的地方，像電影裏那樣在水泥地上消失也太誇張了）。
體質訓練：忍術對於身體訓練的強度也是非常殘忍的。忍術所包括的內容，每一項忍者都必須精通。並且每項訓練，都全是死亡淘汰賽，無法承受的人是不允許生存的。除了常規訓練外，忍術還包括多種“怪力訓練”，忍者通過它進一步磨練意誌，忍耐力，生存能力等等。這種怪力訓練諸如連續數天不食不動，殺死自己的同伴，以及與猛獸搏鬥等，是令人難以想象的。
通過這些死亡率極高毫無人性的修行，忍者從精神到肉體都實現了超人的飛越。獲得了超越常人的毅力、耐力、戰鬥力。通過忍術的訓練而幸存的忍者，個個都是一部絕對可靠的全功率戰鬥機器。
忍者有很多出身於農民，而不是高貴的武士。但是忍者和武士一樣遵從著一套自己的專門規範，就是忍術。忍者學習運用忍術的根本目的不僅是為了獲得登峰造極的暴力和毀滅手段，而且要培養個人同周圍環境的協調，從而產生一種使生來具有道德人類知道並跟隨這種穿越宇宙總綱行動的直覺。