楊繼盛入獄後，曾有人給他送過一副蛇膽，說可以清熱解毒。楊繼盛卻推辭道：“我胸中自有肝膽，不需要這東西。”後來經過幾次杖笞，已經是體無完膚，兩條大腿上的碎肉一片一片地墜下來，而且傷到筋骨，越拉扯越痛。楊繼盛咬住牙根，用手將腐肉挖去，又把吃飯的碗敲碎，撿了一隻碎片，割斷了兩條腿筋。
楊繼盛的妻子張氏是個知書達理的賢婦，之前就知道參劾嚴嵩是白費工夫，於是一再勸阻楊繼盛。可惜楊繼盛不肯聽從，最後被捕下獄。世宗本來不想殺他，卻因被嚴嵩誣陷，牽連到張經的案子裏，於是下令將他一同處決。張氏急得異常悲痛，發誓要替丈夫去死，托人遞了奏折給皇上。那萬惡的嚴嵩怎麼肯輕易將這奏折呈上去，於是張氏的一片苦心，付諸東流。楊繼盛血染法場，沉冤燕市。
兵部侍郎張經等人被趙文華陷害的事情，說來話長。中國沿海一帶，向來有倭寇出沒。明太祖時期，就曾設立防倭衛所，以控製海濱的局勢。成祖年間，明朝官兵屢次打敗倭兵，於是倭寇在很長一段時間不敢來兵侵犯。日本將軍足利義滿，派人向中原納貢，被封為日本國王，從此之後與中國互通有無，並替中國誅殺海寇，隻準商民入市，不準擄掠。因此沿海一帶，還算平安。世宗即位之後，寧波鄞縣人宋素卿畏罪逃到日本，正巧足利義滿去世，足利義植即位。因為政治上過於羸弱，不能製止盜寇，盜寇就與宋素卿聯絡，借著入貢為名，在寧波一帶大肆搶掠。
幸虧巡按禦史歐珠以及鎮守太監梁瑤，設計誘捕宋素卿，將他下獄處死。誰知除了一個，反而引出好幾個。汪五峰、徐碧溪、毛海峰、彭老生雖然都是中原的百姓，卻占據海島，勾結倭寇，在沿海一帶搶掠。巡按浙江禦史這時候已經改任陳九德，他當即上疏請朝廷派兵討伐。世宗就命朱紈為右都禦史，巡撫浙江，兼管福州、興化、泉州、漳州的事宜。朱紈上任之後，下令禁海，早晚練習兵甲，嚴厲糾察，繳獲了很多倭寇的船隻，斬殺倭寇探子數百人。不料禦史周亮等人嫉妒他的功勞，參劾他妄殺倭寇，挑起事端。朝廷竟然下旨奪官，還要嚴刑訊問，朱紈悲憤而死。此後，巡撫禦史的官職一直沒人擔任。
直到嘉靖三十一年，安徽人汪直亡命海上，成為巨寇。徐海、陳東、麻葉等人和他勾結聯絡，縱橫無敵，連海外的倭寇都望風降服，願意受他指揮。汪直隨即登岸，侵犯台州，攻破黃岩，騷擾象山、定海各地，浙東一帶不得安寧。於是朝中大臣商議，再次設立巡撫禦史這一官職，命王忬巡撫浙江，提督沿海軍務。
王忬領命後，馬上起程，按期來到浙江。得知參將俞大猷、湯克寬智勇雙全，就將他們招為臂膀，接著招募士兵，激勵將校，趁夜派俞大猷、湯克寬率兵偷襲倭寇。汪直在普陀山安營紮寨，據島固守。俞大猷帶領精銳士兵，乘著風勢先發製人，湯克寬做後應，徑直向賊寨撲去，四麵放起火來。汪直等人猝不及防，慌忙逃走。官軍追殺過去，斬獲一百五十枚倭寇的首級，生擒一百多名俘虜，另外燒死、溺死的不計其數。汪直逃到福建海域，又被都指揮尹鳳迎頭痛擊，殺得七零八落，狼狽逃竄。浙江經此一戰，人心安定了許多。
哪知這汪直刁蠻狡猾得很，又去勾結倭寇，大舉進犯。調集了幾百艘戰艦，蔽海而來，浙東、浙西同時告警。王忬派湯克寬防守東麵，俞大猷防守西麵，兩將如同砥柱一般，捍衛中流，任憑汪直如何勇悍，也不能越雷池一步。汪直隻好改變計劃，開始北犯，轉去侵略蘇州、鬆州。這兩個地方向來富饒，又沒什麼守備，倭寇乘虛而入，肆意搶奪。
倭寇頭目蕭顯殘暴凶悍，帶著幾十名寇匪，在上海、南彙、川沙一帶大肆屠殺，直逼鬆江城。剩下的賊兵圍攻嘉定、太倉，所過之處，燒殺搶掠，無惡不作。王忬急忙派都指揮盧鏜火速襲擊，突入蕭顯的大營內。蕭顯措手不及，慌亂中被殺死，賊兵大亂。盧鏜等人麾兵截殺，砍去無數頭顱。剩下那些沒殺完的毛賊，逃回浙江境內，恰巧與俞大猷相遇，霎時間被殺得精光。隻有汪直這一路，攻破昌國衛，直撲乍浦、青村、柘林等地，沿途奸淫擄掠，禍害百姓。王忬又調湯克寬北上支援，卻遇到了瘟疫，士兵大多得病。湯克寬無可奈何，隻好任由倭寇北竄。汪直一直攻入江北，震驚山東。那時朝臣又要參劾王忬，說他以鄰為壑，坐視不理。還算世宗包容，沒有加罪，隻是改封他為右副都禦史，調去巡撫大同，另命徐州兵備副使李天寵代任。