1999年，蓋茨撰寫了《未來時速》一書，向人們展示了計算機技術是如何以嶄新的方式來解決商業問題的。這本書在超過60個國家以25種語言出版。《未來時速》贏得了廣泛的讚譽，並被《紐約時報》、《今日美國》、《華爾街日報》和Amazoncom列為暢銷書。
2000年，蓋茨任命他長期的好友史蒂夫·鮑爾默（SteveBallmer）為微軟首席執行官，而自己則為“首席軟件設計師”（ChiefSoftwareArchitect）。
2001年底，微軟推出了WindowsXP。蓋茨親自來到時代廣場推銷WinXP。
2006年3月10日，2006年美國福布斯“全球富豪榜”揭曉，微軟的比爾·蓋茨連續第12年成為世界最富有人士，他的淨資產由465億美元增至500億美元。
2006年4月18日，中國國家主席胡錦濤訪問了微軟的總部——西雅圖附近的雷德蒙德市。蓋茨和史蒂夫·鮑爾默會見了胡錦濤，並帶領胡錦濤主席參觀了微軟的“未來之家”。下午18點30分左右，胡錦濤出席了蓋茨在家中設的晚宴。
2006年年底，WindowsVista如約而至。
2009年10月Windows7問世。
除了對計算機和軟件的熱愛之外，蓋茨對生物技術也很有興趣。他是ICOS公司董事會的一員，這是一家專注於蛋白質基體及小分子療法的公司。他也是很多其他生物技術公司的投資人。蓋茨還成立了Corbis公司，它正在研究開發世界最大的可視信息資源之一——來自於全球公共收藏和私人收藏的藝術及攝影作品綜合數字檔案。此外，蓋茨還和移動電話先鋒CraigMcCaw一起投資於Teledesic。這是一個雄心勃勃的計劃，計劃使用幾百個低軌道衛星來提供覆蓋全世界的雙向寬帶電訊服務。
永遠的朋友——溫布萊德
蓋茨在剛剛開始創業的時候並沒有吸引女士們太多崇拜的目光。因為他從小寡言少語、不善社交，平日也隻是坐在桌前和電腦打交道，有時一坐就是幾十個小時，飯都很少去吃，更別提抽出時間來洗澡和打扮自己了。那時，蓋茨周圍的人經常可以從他的身上聞到一股臭味兒。
然而，由於工作的關係，一個學者味兒十足的女人走進了他的生活。這個女人就是比蓋茨大9歲的安·溫布萊德。由於二人所學的專業相近，又都從事計算機軟件開發的行業，所以特別談得來。很快，兩個人就開始同居了。在蓋茨看來，他與溫布萊德之間的關係是一種純粹的“柏拉圖”式的精神戀愛。他們經常在一起談論有關計算機和物理學的問題，有時一個問題就能爭論一個星期。但是，好景不長，1987年，蓋茨和溫布萊德正式分手了。盡管二人之間不再有戀人關係，卻仍然保持著友誼，而且還時不時地聚在一起討論問題。
對於蓋茨來說，溫布萊德是他的大姐大。在很多個人的事情上，蓋茨都事先與她商量。1993年，蓋茨最終選擇了美琳達做自己的人生伴侶。在這之前，蓋茨也考慮了很久，他還給溫布萊德去電話，征求她的同意。很多了解蓋茨的人說，如果溫布萊德不允許，蓋茨是不會迎娶美琳達的。
1994年1月，蓋茨與美琳達完婚。在婚禮宴席之後，蓋茨向美琳達提出，他要與溫布萊德繼續保持友誼，而且每年還要抽出一個星期的時間與溫布萊德呆在一起。對於蓋茨近乎無理的要求，美琳達居然同意了。據蓋茨說，他雖然每年都要和溫布萊德在一起呆一段時間，但是兩人隻是在一起談論一些計算機上的問題而已。