抗菌藥物是臨床上最常用的藥物，孕婦使用不當也會對胎兒造成危害。下列幾種抗菌藥物孕婦不宜使用。
（1）磺胺類。常用的如複方新諾明，磺胺密啶等。孕婦用藥15分鍾後胎兒血中藥物濃度可達母體的80%～90%。由於胎兒對磺胺類的解毒能力低、排泄慢，故最後胎兒血中藥物濃度可超過母體。妊娠早期使用這類藥物可能影響胎兒器官發育而致畸胎，妊娠後期使用易使胎兒產生溶血性貧血，還可幹擾其膽紅素的代謝，使胎兒血中膽紅素增高，嚴重的可致核黃疸，造成死胎，或出生後新生兒智能障礙、抽搐。
（2）氯黴素。此藥可影響胎兒造血，使其發生再障。因胎兒對此藥的代謝能力差，可在胎兒體內蓄積，影響新生兒的心血管功能，致使其出現嘔吐、呼吸急促或不規則，膚色發灰，低體溫、軟弱無力等症狀，以致造成死亡。這在醫學上稱為“灰嬰綜合征”。
（3）四環素。四環素可與鈣鹽結合，對胎兒的骨及牙齒的生長均可產生不良影響，可造成牙釉質發育不良，長骨生長遲緩。如懷孕後期應用，可使乳齒永久性發黃。四環素還可沉積於眼球組織，引起先天性白內障。
（4）氨基甙類抗生素。如鏈黴素、慶大黴素、卡那黴素、丁胺卡那黴素等都屬於這一類。可引起先天性耳聾，大劑量可導致流產。
總之，孕婦如發生細菌性感染疾病，應在醫生指導下謹慎用藥。一般來說，青黴素類、頭孢菌素類、紅黴素、磷黴素、潔黴素等對胎兒的毒性較小，因為它們產生抗菌作用的機製是阻礙細菌細胞壁的合成，而人體的細胞隻有細胞膜，沒有細胞壁，所以對人體基本無害。