2月：
9日，清廷免直隸光緒十三年以前灶課（鹽稅）。
15日，光緒特諭：本年萬壽節（光緒二十歲生日）不行告祭，停止升殿賀禮；免各省文武大員來京祝壽。
3月：
4日，張曜奏稱：統核山東河工所費，共銀二百八十八萬兩有餘。光緒命有關部門籌給。
8日，駐藏幫辦大臣升泰，與英國駐印總督蘭士丹在孟加臘城議訂《藏印條約》八款。英國曾急欲北侵西藏而吞並之，並先收哲孟雄、不丹、廓爾喀三國為保護國。西藏番兵於光緒十四年（1888年）派兵入哲孟雄，築堡於隆吐，嚴阻英國商旅通過。英國準備出兵攻擊。清廷總理各國事務衙門聞此，即與英國駐華公使威妥瑪議訂條約，阻止英軍入藏。清廷亦飭令藏人速撤隆吐寨卡。駐藏大臣文碩上疏抗爭，謂該處為藏地，不可撤兵。清廷斥文碩迂謬，撤其職，令還京，以升泰代其職。旋英軍侵入哲孟雄。攻毀隆吐卡房，藏兵退還。9月藏兵複與英兵開戰，藏兵失敗。咱利、亞東、朗熱等隘，同時失去。升泰即時派員赴邊，阻止英軍，同時勒令藏軍解散，與英國官員保爾會談邊界條約。清總理衙門，亦派總稅務司前往幫辦，本日（1890年3月8日），條約八款成立。其主要內容是：（一）承認哲孟雄為英國保護國。（二）劃定藏哲分界：以自布坦交界處之支莫摯山起，至廓爾哈邊界止，哲屬地為梯斯塔及近山南流諸小河；藏屬地為莫竹及近山北流諸小河，以山項為界。（三）關於通商、遊牧諸事，另行派員議定。
11日，清當局殺台灣內社番反清酋長有敏等。
19日，三湘槍炮廠創辦。
21日，賑桂林各屬火災。
24日，湖北織布局設立。
28日，清廷命左太仆寺少卿張蔭桓在總理各國事務衙門行走。
本月，免榆林等州縣光緒十三年欠賦；除去東川受災官田稅糧，免直隸文安、靜海、霸州澱泊欠租，及伯都訥地課。
4月：
13日，曾紀澤卒。光緒命李鴻章整頓北洋水陸軍；定安等負責訓練東三省兵。
19日，懿旨：劉銘傳幫辦海軍事務。青海西寧地震，清廷予以撫恤。
5月：
10日，以光緒皇帝將二十歲，頒詔天下，對官員節婦、老年人或升級或賞賜不等。
14日，疏浚餘杭南湖。
同日，以瞻對番目撒拉擁珠與巴宗喇嘛聯結野番作亂，清廷命官軍剿平之。
21日，前兵部尚書彭玉麟卒。諡“剛直”。彭玉麟（1816～1890），湖南衡陽人，曆任巡撫、兵部侍郎、兵部尚書，為湘軍鎮壓太平軍主將之一。彭待部下如布衣昆弟，而紀律極嚴。巡閱長江水師時，罷營、哨官一百八十二人，江湖肅然。將佐畏之如神；地主有司亦望風震懾；民間不軌之徒亦甚畏之。
29日，光緒諭：整頓土藥、稅厘，命剛毅詳察徐州土藥種植及征稅實額，並嚴定整理章程。
6月：
12日，授吳魯、文廷式、吳蔭培等三百三十六人進士及第、出身、同出身。
17日，日蝕。
19日，色楞額卒，清廷命長庚為伊犁將軍。
24日，命駐藏幫辦大臣升泰為駐藏辦事大臣。
25日，朝廷下旨：前湘軍之已故福建陸路提督蕭孚泗，因戰功於立功地建祠，並將生前戰績宣付史館。