1月：
5日，清廷命貽穀督辦晉邊墾務。山東章邱黃河決口處合龍。
7日，西太後、光緒抵京師。
8日，皇帝下詔追封珍妃為貴妃。（珍妃於1900年8月被西太後秘密處死於井中）。命翰、詹、科、道及各署司員預備召見。
10日，派張百熙為管學大臣。命王文韶仍督路礦，瞿鴻璣、張翼副之，袁世凱督辦關內外鐵路事宜，胡燏棻為會辦。
12日，設外務部左右丞、左右參議，以瑞良等出任。
13日，申諭中外臣工，重邦交，安民、教。
同日，以結納拳民誤國，罷左副都禦史何乃瑩、侍講學士彭清藜、編修王龍文、知府連文衝、曾廉職。
17日，皇室祭大社、大稷；遣睿親王魁斌等告祭於方澤（地壇），朝日壇，夕月壇。
19日，命袁世凱參預政務處。
21日，命鎮國將軍載振充赴英國專使，賀英王加冕，旋晉升載振為貝子銜。
28日，孫中山自日本抵達香港，住《中國日報》社。但香港政府，違背規定，勸其離開香港。孫中山複又返回日本；在日本與中國留日學生接觸，爭取學生加入革命運動。光緒於乾清宮見各國公使。
31日，命瞿鴻璣為軍機大臣。授孫家鼐為體仁閣大學士：
本月，賑濟兩宮路過地區貧民。賑廣西等地災。
2月：
1日，西太後、光緒於養心殿接見各國公使及其夫人；朝廷下詔準許滿漢通婚。
7日，光緒至保和殿，筵宴蒙古王公及文武大臣。
8日，梁啟超主辦之《新民叢報》在日本橫濱出版，仍宣傳變法維新，並反對革命。
13日，朝廷派吳汝綸為京師大學堂總教習。
17日，光緒祈穀於上帝。
19日，四川提督宋慶卒，追封三等男爵。
23日，命張翼總辦路礦事宜，王文韶、瞿鴻璣為督理；命呂海寰會同盛宣懷協議商約。
24日，罷東河河道總督缺；命各省大吏清理屯田，改屯餉為丁糧；撤衛官為營；屯丁、運輸兵，一並罷除之。
同日，諭各省設立農工學堂。
3月：
6日，罷詹事府、通政使司，前者歸並翰林院。
本月，清政府下令保護出洋回國華商。
直隸總督袁世凱、兩江總督張之洞奏請遞減科舉。
10日，命張德彝為赴日斯巴尼亞（西班牙）專使，賀其國君加冕。
11日，朝廷諭命各省盡快設立學堂及武備學堂。
同日，命各出使大臣查取各國通行律例；責成袁世凱、劉坤一、張之洞慎選人才，保送來京聽用。開館編纂新律法。
12日，廣西發生殺死法國軍官事件。
28日，劉坤一乞疾免，慰留。
本月。盛宣懷奏請設立勘礦公司。朝廷允準。
4月：
8日，奕劻、王文韶與俄國駐華公使雷薩爾議訂收回東三省條約成立；共四款：
（一）東三省各地，仍同俄軍未占領時一樣，回歸中國版圖，歸中國政府治理。（二）俄國軍隊在一年半內，分三期撤走。（三）俄軍撤退前，中國在東三省駐軍數目、駐地，必須與俄軍商定，俄軍撤退後，中國在東三省兵力之增減，應隨時知照俄國政府。（四）俄國交還山海關、營口、新民屯沿線鐵路，清政府予以賠償。
此條約之二、三條，有損中國主權。即使如此，俄國仍不執行。1903年4月，第二期撤兵時，沙俄不但不按約撤兵，反而增兵八百人至東安，重新占領營口。並又向清政府提出俄國交還中國之領土，中國不得以任何形式轉讓他國等七條，清政府予以拒絕。沙俄則借此廢除《交收東三省條約》，重新侵占奉天。
11日，光緒於乾清官見意大利使臣戛厘納。
12日，光緒於先農壇親耕耤田。
26日，章炳麟等於日本東京上野精養軒舉行中夏亡國二百四十二周年紀念會，發表宣言號召推翻滿清政府。宣言曰：“願吾滇人勿忘李定國；願吾閩人勿忘鄭成功；願吾越人勿忘張煌言；願吾桂人勿忘瞿式耜；願吾楚人勿忘何騰蛟；願遼人勿忘李成梁……庶幾陸沉之痛，不遠而複”；強調反滿複漢之種族革命，未言民主政治。孫中山亦與華僑十餘人參加此會。香港《中國日報》（陳少白主辦），將此宣言刊登，以廣宣傳。章炳麟（1869～1936），字枚叔，號太炎，浙江餘杭人，大儒俞樾之學生。1897年任上海《時務報》撰述，擁護變法維新。戊戌政變後被通緝，逃亡日本，刊印《訄書》。1900年參加上海張園會議，矢誌革命，又被追捕亡命日本。1903年於上海愛國學社講學，與鄒容成為忘年交，為《革命軍》寫序言，入獄。1904年於獄中策動組織光複會。1906年出獄赴日本參加同盟會。1912年為南京臨時政府顧問。參加護國、護法之役後，脫離革命，組織孔教會。“九一八”後，支持學生抗日運動。1936年逝世於蘇州。