發光器還被用來迷惑敵人，保護自己。所謂敵人，既包括捕食者，也包括被捕食的對象。許多魚如燈籠魚的發光器多位於身體腹麵。當它們夜間遊到上層捕食浮遊生物時，明亮的月光灑在海麵上，若從下方往上看，海水有些發亮。一隻不發光的魚在月亮照射的海麵背景上能很清楚地顯示出它的黑色輪廓，很容易被其下方的捕食者所發現，憑敏銳的視覺對其攻擊。魚腹麵的發光器一發光，就使自己和月光照射下的上部水色相一致，從而消除了本身的黑色輪廓，就不易被捕食者發現。這種效應稱作消光效應。除魚類外，烏賊及一些遊泳蝦類腹麵的發光器都有這種效應。
許多燈籠魚尾部的發光器也主要用來逃避捕食者。當被凶猛捕食者追捕或它本身發現有什麼不祥之兆時，就用尾部發光器發出明亮的閃光，往往會使捕食者大吃一驚，當敵人迷惑不解地把注意力集中在閃光點上時，給了被捕食者一個逃跑的機會，被捕食者就趁機加速遊開了。
事物往往是這樣的，有矛就有盾。一些魚可以通過消光效應而逃避捕食者，而另一些魚則可以利用這種效應捕獲食物。最典型的要算星光魚。它一方麵利用本身腹麵的發光器產生消光效應，逃避捕食者，同時還有一雙特殊的眼睛能識別出正在消光的魚。星光魚的眼方向是朝上的，眼裏有一個黃色晶體，這實際上是一種濾光器，能將光波範圍很寬的背景光過濾掉，識別出光波範圍狹窄的有特殊顏色的生物光。當星光魚向上方觀察月光照耀下的海水時，一眼就能識別出正在用發光器消光的潛在獵物。這實際上正好利用了獵物的防禦機製來捕獲獵物。