謎之一：水星是如何誕生的？太陽係由九大行星，其中水星、金星、地球、火星及冥王星，是以岩石為主要成分的“地球型行星”；木星、土星、天王星及海王星，是大量氣體包圍的“木星型行星”。
最靠近太陽的行星是水星，它是如何誕生的呢？有兩種說法：一種說法是：由於水星最靠近太陽，科學家認為水星是在原始太陽係星雲中的高溫區域，由凝固的金屬鐵及其他富含物質的材料物質堆積而成；另一種說法是：水星是在巨大的原始行星互相碰撞的時候，由彼此的金屬鐵融合而成的。
謎之二：金星為什麼灼熱？金星的大小和地球最接近，兩顆行星的內部構造可能也很相似。但根據探測船和雷達觀測，金星是一個灼熱的世界，如同煉獄，表麵籠罩著二氧化碳的濃厚大氣。地表溫度高達450℃左右，是地球地表溫度的30倍。
由於金星靠近太陽，當太陽能量上升之後，金星上的水化為氣體釋出到大氣中。這時，原本溶於海中的二氧化碳也積存大氣中，引發強烈的溫室效應，導致地表溫度暴增。
謎之三：木星為什麼有大紅斑？地球人觀測位於木星南半球的大紅斑，已經有300多年了。大紅斑差不多有兩個地球那麼大。
大紅斑是反時針旋轉的高度壓雲形成的巨大旋渦。它之所以呈現紅色，是因為雲下層的磷化氫被搬運到上空，受到太陽紫外線照射而轉化為磷的緣故。大紅斑是如何形成的呢？目前科學家還不清楚。
謎之四：氣體衛星為什麼有環？木星、土星、天王星、海王星全部有環，各不相同。土星的環又薄又暗，由岩石粒子構成。土星的環又大又亮，有水冰構成。環的成因，有幾種不同的說法，其中一種是：過去存在的衛星或彗星被行星的潮汐力破壞，分裂成小碎片，有的碎片進入環繞行星公轉的軌道，因而形成了環。
謎之五：冥王星以外有什麼？以前有人主張，冥王星以外可能有第十顆行星。
1992年夏天，科學發現冥王星軌道外麵有一顆直徑250公裏左右新天體接著41顆軌道長半徑大於海王星的天體陸續現身。
此外，1950年，天文學家歐特統計了當時已經觀測到的周期彗星的軌道，結果發現絕大多數周期彗星都是從距離太陽幾萬AU(天文單位)的地方全方位飛來，可能有一個呈球殼狀包住太陽係的彗星巢。整個彗星巢，叫做“歐特雲”。
謎之六：太陽係盡頭在哪裏？科學家說，太陽會噴出高能量帶電粒子，稱為“太陽風”。太陽風吹刮的範圍一直達到冥王星軌道外麵，形成一個巨大的磁氣圈，叫做“日圈”。日圈外麵有星際風在吹刮，但是太陽風會保護太陽係不受星際風侵襲，並在交界處形成震波麵。
日圈的終極境界叫做“日圈頂層”，這就是太陽所支配的最遠端，可以把這裏視為太陽係的盡頭。
至於日圈層頂距離太陽有多遠？它的形狀如何？“航海家1號”和“航海家2號”已分別飛到距離太陽66AU和51AU的地方，希望日後能夠揭開太陽係最遠端的麵貌。