5.在公司化過程中積極引進社會資金，探索職工持股，實現資本結構多元化，形成有效的激勵機製和約束機製。
6.通過業務部門公司化方式實現創業中心服務職能在創業中心引導、扶持下有序地社會化，從而有利於引進高素質人才，擴大服務能力和培育水平。
7.加強對公司的財務監控，全資子公司不單獨設立財務部門，由研究所實行集中管理，提供財務服務。各公司實行獨立核算、自負盈虧。
8.明確研究所職能管理部門的崗位設置和職責，包括中層幹部在內，實行競爭擇優上崗的全員勞動合同製。
三、改革實施辦法
（一）崗位設置
研究所改革後的崗位設置為：總經理、副經理、部長、副部長、主管、一般職員、技工、臨工。
（二）改革後機構設置
1.部門職責及定員
各職能管理部門隻設正職負責人，不設副職。任職的基本條件為：45歲以下，大專以上學曆，中級以上職稱。
辦公室與人事部
職責範圍：負責綜合協商、督辦執行、文秘、印章、機要檔案、人事、工資福利、黨務、共青團、工會、婦女、計劃生育、接待、安全、車輛等管理工作。設負責人×人，職員×人。
財務部及審計部
職責範圍：負責財務計劃和預算、經濟核算和決算、賬簿登記、統計、編製會計報表、資金、賬戶和印鑒、發票的管理、納稅申報、財務審計、證照年審、工資資金發放、收繳房租和管理費等工作。設負責人×人，職員×人。
投資管理部
職責範圍：負責對投資項目的策劃篩選、推薦、立項、管理；投資項目後期的股權轉讓和收益分配；為科技企業提供投融資的中介服務、技術交易、信息化管理等工作。定員由投資管理公司自定。
企業發展部
職責範圍：負責對孵化用房的租賃；孵化高新技術項目，培育科技企業，培訓科技人才等方麵的組織工作；對進駐企業（包括留學生企業）的新辦高新技術企業認定、申報專利、申報各類科技項目和專項基金、成果鑒定和獎勵、溝通與政府及有關職能部門的聯係；組織參加各類交流會和展覽會；孵化協會的組織管理等工作。定員由創業谘詢公司自定。
綜合管理部（科技服務公司）
職責範圍：負責物業、後勤、招待所、停車場管理；進駐企業退房的驗收和管理；固定資產、設備、辦公用品的購置、維修、發放、管理、綠化、衛生的管理；基建工程項目的申報、施工、驗收等工作。定員由科技服務公司自定。
2.子公司
風險投資公司：（職能略）。
投資管理公司：承擔為企業申報項目、融資和投資者進行投資管理等業務。
創業谘詢公司：引進項目、孵化場地出租和企業管理。並發展相關新業務的延伸服務。如：代辦企業工商注冊、稅務登記、年審、高新技術企業認定、軟件企業認定等。
科技服務公司：負責××區物業服務和相關新業務。如：客貨運代理業務、餐飲服務、郵政代理服務、招待所服務、為創業科技人員提供配套的生活服務等。
子公司內部機構的設置由各子公司根據各自業務情況自行設置。研究所與各子公司的關係體現為：
（1）子公司各自實行經濟獨立核算。（略）
（2）對非全資子公司實行董事會領導下的經理責任製，全資子公司則實行研究所領導班子領導下的經理責任製。各子公司經理負責製定各公司的經營計劃、機構設置、用工和分配製度，交董事會或研究所領導班子通過後執行。
（3）在×年～×年內，研究所對各子公司實行經營保護，以扶持各子公司的發展，以後將逐漸向社會開放業務，實現公開公平競爭。
（4）研究所將努力引進社會資源，共同投資，使各子公司的資本結構逐漸實現多元化，從而通過法人治理方式對各子公司進行管理。
（三）用工製度
根據研究所製定的《勞動人事管理規定》，打破現行幹部和工人界限，專業技術職稱實行評聘分開，允許高職低聘，低職高聘，改變過去的身份管理為崗位管理。對職能部門負責人及員工按照崗位設置、職責要求，麵向社會公開招聘。研究所與應聘人員采取雙向選擇，競爭上崗，擇優聘用，簽訂勞動合同，確立雙方的權利與義務。研究所在選擇和聘用人員時，將優先考慮和聘用現有員工。改革後被繼續聘用的原研究所員工，應重新與研究所或子公司簽訂勞動合同，其人事檔案仍由研究所保管。