“梁眾精勇，嵩不能克”，皇甫嵩隻得“閉營休士，以觀其變”。可是，在十月間的一場戰鬥中，由於義軍疏忽大意，皇甫嵩“潛夜勒兵”，雞鳴時進撲義軍陣地。義軍倉促接戰，張梁陣前犧牲。與張梁一道戰死的有三萬多人，其餘不甘屈服，投河而死者五萬餘人。同年十一月，皇甫嵩軍又攻破下曲陽，張寶等十多萬義軍被殺害。殘暴的東漢統治者對農民展開了血腥的報複，因張角已先病死，竟棺戮屍，傳首京師”，並在下曲陽城南積屍封土，築為“京觀”。這種野蠻的行徑，並沒能改變東漢統治者覆滅的命運。
黃巾軍的主力雖然被鎮壓，但是農民的反抗鬥爭並未停止。中平二年（185），黃巾餘眾和各地饑民，又舉起各種各樣的旗幟，活動在黃河以北的原野上。據《後漢書·朱雋傳》雲：“自黃巾賊後，複有黑山、黃龍、白波、左校、郭大賢、於氐根、青牛角、張白騎、劉石、左髭丈八、平漢、大計、司隸、掾哉、雷公、浮雲、飛燕、白雀、楊風、於毒、五鹿、李大目、白繞、畦固、苦蝤之徒，並起山穀問，不可勝數。”其中大者二三萬，小者六七千。黑山軍首領張燕（即張飛燕，原姓褚，張牛角戰死，改姓張）聯絡太行山東西各郡農民軍，發展成為百萬人的隊伍，號黑山軍，勢力最為強大。他們長期堅持抗擊官軍和袁紹割據勢力的鬥爭。繼黃巾軍而起的暴動集團人數眾多，但由於缺乏統一領導和組織，各個集團分散行動，互不相屬，因而不能集中力量，整齊步伍，向著共同的敵人進軍。張燕雖與諸山穀“寇賊”更相交通，但他並不能把各集團領導起來，而且他的反抗意識並不堅定，起事後不久，即“遣使至京師，奏書乞降”，被東漢政府任命為平難中郎將，使領河北諸山穀事。
中平五年（188），當時分散在青州、徐州、兗州、豫州、並州的黃巾軍餘部，再次發動起義。如郭太起於西河白波穀（今山西襄汾），活動於太原、河東諸郡，抗擊董卓的軍隊。同年十月，青、徐一帶黃巾複起，聲勢巨大。徐州黃巾軍為陶謙阻擊後，攻破北海。北海太守孔融懾於起義威勢，出屯都昌（今山東臨朐境），複被起義軍管亥所部包圍，直到劉備兵到才解圍。青州黃巾再起後，先後進攻泰山、兗州、東平等地，殺死任城相鄭遂，兗州刺史劉岱，發展至百萬人。曹操傾全力阻擊這支義軍，在壽張東與義軍“晝夜會戰”，被義軍擊敗，濟北相鮑信被殺。義軍人數雖多，但婦女老幼等非戰鬥人員占三分之二以上，軍需供應全靠“鈔略”補給，這就為其流動作戰帶來極大困難。初平三年（192）這支義軍被曹操所收降，曹操簡其部分精銳，組成“青州兵”，成為他後來統一北方的一支重要軍事力量。而黑山軍在被東漢政府招撫後，後又“漸寇河內，逼近京師”，直至建安十年（205年）夏四月，才由張燕率領其眾十餘萬人歸降曹操。黃巾大暴動，至此宣告結束，但東漢政權，也被割據勢力所瓜分，曆史進入豪族混戰的局麵，東漢王朝名存實亡。
注釋
①《後漢書》卷七《桓帝紀》。
②《齊民要術》卷三引崔寵《四民月令》。
③《全後漢文》卷四六。
④⑤⑥⑦《後漢書》卷五四《楊震傳附楊賜傳》。
⑧⑨《後漢書》卷五七《劉陶傳》。
⑩《後漢書》卷七一《皇甫嵩傳》。
《後漢書》卷七八《宦官列傳·張讓傳》。
《後漢書》卷六四《盧植傳》。
《後漢書》卷七一《皇甫嵩傳》。
《後漢書》卷七一《朱雋傳》。