梁台建後，鄧元起為益州刺史，上表推薦庾黔婁為府長史、巴西梓潼二郡太守。鄧元起平定成都後，城中珍寶堆積如山，鄧元起一一分給下屬，隻有庾黔婁一個人絲毫不要。鄧元起討厭他一個人異樣，厲聲說：“長史為何偏偏這樣！”庾黔婁看那樣子不好違命，就請求給他幾箱子書。不久，被任命為蜀郡太守，在職清廉儉樸，百姓受其益，鄧元起死於蜀，部屬都離散而去，庾黔婁親自料理喪事，扶持靈柩歸葬鄧元起家鄉。