臨潭的舊洮一帶，也是回民聚居的地方，馬仲英等到這裏，結合當地回民，聲勢又大了起來。十月二十九日馬仲英部到達岷縣，因為這裏是產糧地區，想叫部眾在這裏休息一個時期再向前進。韓進祿所率馬廷賢部則東入岷縣、禮縣間的閭並山區，和多年盤踞在這一帶的悍匪王占林、馬應彪等會合。旋因部隊過多，勢難在這裏長期屯聚，乃商談前進路線。馬仲英主張透過隴西向寧夏轉進。韓進祿則主張東撲天水進據隴南。意見不一，乃分途進行。馬仲英到達隴西，圍攻未下，國民軍吉鴻昌部馳至救援，馬仲英與戰不利仍退回岷縣。韓進祿到達天水時，吉鴻昌已從隴西馳到天水，從間道先入天水，偃旗息鼓，表示空虛。等韓進祿撲到城邊，攻擊的火力疲乏下來，吉部才發射大炮，出城突擊，打了個落花流水。韓進祿走投無路，不得不折轉向西，跟在馬仲英後邊，也回向岷縣、臨潭。
先是韓進祿部下的撒拉回民，在經過舊洮和岷縣間的藏族地方時大肆騷擾，和藏民結下了冤仇。但在後麵攜眷緩行的馬廷賢還認為卓尼藏民首領，曾和他們有聯絡，很坦然地前進，卻不料所帶護衛人少，一踏進藏區，就被藏民中途截殺，眷屬財物完全被擄。他隻身奔竄，不是情急智生，割開錢袋，使藏民在搶拾散錢中鬆口氣，險些丟掉了性命。逃脫之後奔到馬仲英部請其報仇。馬仲英一努之下，把部隊開進卓尼，焚毀了曆史悠久的禪定寺，清洗了灣科落、康木闡等村落，和藏民結下更深的仇怨。十二月初間，國民軍吉鴻昌、馮安邦等部跟蹤追到洮岷，馬仲英等被迫離開岷縣，從藏區向西寧退走。馮安邦在臨潭舊城槍斃河州來這裏避難門宦頭目數十人，燒毀房屋數十家。馮部於次年一月十一日攻陷長拉麻川村落，燒殺居民老幼一千餘人。在兵火之後，臨潭縣長魏錫周又勾結藏民首領，對回眾橫施壓迫，激起回民馬尕喜順的反抗。至五月內國民軍李鬆崐部擊敗了馬尕喜順，將聚在清真寺未逃出的回民，不分良莠，放火燒殺。七月初以軍事平定，召集逃出的難民上莊，萬餘人齊集舊城，聽候點名，竟被騙進西門，十八人一練，押出南門，活埋於預先挖好的十三個萬人坑內，備極淒慘。
另外，這次馬仲英、韓進祿先後由隴西、天水敗退，馬仲英攻渭源城不克，殺鍬峪鄉鄉團甚眾，官堡南邊的喬家溝居民亦橫遭殺戮。西軍王占林部道經岷縣顆馱村，派人向堡中要糧，堡中欺其人少，態度強硬。正談判間，一青年開槍打死王占林兵士一名，王占林立即指揮部隊將堡攻開，燒殺一天。除了先一天因事外出的少數人外，留居在堡中的八十多戶人家竟無一人幸免。還有馬應彪部已投降省軍，在定西改編，又從固原叛變西行，乘虛入隴西縣城及漳縣縣城，劫掠財物甚多。他們經過山岔鎮時，也因堡內人民發槍抗拒，一怒攻破堡寨，雞犬不留。像這慘殺的作風，就都離開了起義的目標，給這些地方留下永遠不忘的慘痛印象。
六、馬仲英等轉入河西，攻克寧夏
約略是一九二九年春天，馬仲英又從藏區轉入西寧地帶。他們先下貴德縣城，然後間道至西寧市西麵，隨又和馬步元裏應外合，攻下了湟源，殺三千餘人。接著又攻大通，將進入河西。馬麒慌了，為了表示對國民軍的忠誠，特派他的弟弟馬麟前往截擊。在老虎灘地方和馬仲英接觸，由於部眾對馬仲英同情，這一戰使馬麟遭到了慘敗，不是換馬逃走，幾乎在陣前被俘。馬仲英雖然勝了，因當時孫連仲部在西寧未動，不敢冒險深入，遂從扁都口走入河西。
先是甘州鎮守使馬麟一貫對國民軍表示服從，當劉鬱芬和張兆鉀作戰時，他曾派一部分隊伍前往助戰。這次河州、涼州事變發生，他仍然保持舊日態度，部下官兵多不讚同，屢謀嘩變，皆以他的痛哭勸解未成事實。一九二八年八月，馬鴻賓奉馮玉祥命，赴河州議和，劉鬱芬電調馬麟也赴河州做宣慰工作。臨起身時部眾又謀叛變，馬麟涕泣勸導，並補發了欠餉，才勉強成行。但是馬麟剛走到永昌，所部因聽得馬廷勷在涼州一帶和國民軍作戰，終於全部嘩變。一部竄向洪水鎮擄掠屠殺，一部擁馬麟南入湟源，直到孫連仲入湟中，馬麟才恢複自由，投向蘭州。