馬憲成也得到了房寰奏疏的原稿，看過之後，心裏既十分詫異，更覺得無比憤慨：虎毒尚且不食子，那個海瑞竟以居家小德虐殺親女，真真非常人常理可以度之！更何況，所謂事急從權，嫂溺，叔援之以手，連朱子大儒都不以為違禮，這是聖賢早有定論的至理，他的女兒不過從男仆手中接過了一隻餅，未必就觸及肌膚，有何失德之說，可見此人執拗迂腐一至於斯，聖賢書都讀到狗肚子裏去了！
不過，因為此事太過匪夷所思，馬憲成還有些不相信，又專程寫信給那些江南任職的門生故舊，委托他們打聽房寰疏論之事的真偽，各人回信有信誓旦旦說確有其事的，也有謹慎小心說或可有之的，不一而足，卻沒有一個人敢打包票說純屬捏造。
馬憲成思量再三，覺得房寰是嚴嵩的門生，卻能如此不避嫌疑地疏論與他座師有仇的海瑞，應該不會是空穴來風，便在心裏暗暗罵了幾句“名教罪人”、“衣冠禽獸”之類的話。而且，海瑞既然做出這種事，已激起了官場士林的公憤，自己再替他說話已是十分不妥，但要迎合嚴嵩落井下石，馬憲成卻做不出來。恰逢年底，他就按照李春芳當日的指點，責令戶部將海瑞考功定了個“中平”，報吏部考功司記檔。
戶部將職官考功結果報到吏部的第二天，就有內侍來內閣傳皇上召他入內覲見的口諭，馬憲成以為是給海瑞定的考功等次出了差錯，卻不知道皇上到底是覺得低了還是高了，心中著實忐忑不安，跟著傳旨的內侍進宮，隻顧埋頭想事，一路竟被那無數道門門檻絆倒了兩三回，唬得那名內侍連聲說：“馬老先生慢點走，仔細跌壞了，奴婢可擔不起罪。”他這才收斂心神。
來到東暖閣，皇上照例賜座看茶，然後問道：“馬閣老，眼瞅著就要到年底了，今年的收支，戶部匡算出來了沒有？”
皇上早有不必起身回話的規矩，馬憲成就坐在椅子上微微欠了欠身，說：“回皇上，大致已匡算出來。微臣正命戶部有司再與各部核實賬目，待核查無誤之後，正式具文呈報皇上。”
盡管知道這是每年的例行公事，馬憲成不會延誤，但朱厚熜還是稱讚了他一句：“朕就知道，到了年底，你馬大司徒不會不盤清家底，讓朕過個舒心年的。怎麼樣？能把大數目說一說嗎？”
馬憲成在戶部任職二十多年，凡涉及國家財政，事無巨細孰論古今，他都了如指掌，不假書簿也能對答如流，更不用說皇上問到的是他最關心的朝廷收支平衡問題，這當然更難不倒他，張口就來：“回皇上，今年我大明兩京一十三省應收兩稅（封建王朝以田賦、丁稅為正稅，簡稱“兩稅”）折銀3894萬兩。商業稅收入總計940萬兩，包括鹽稅250萬兩、茶稅110餘萬兩、通過稅360萬兩、營業稅220萬兩。此外，還有西北馬市的晉商和東南海市的徽商上繳朝廷利潤約合200萬兩。以上三項合計5034萬兩。除去糧米布帛等實物及各省未如數繳齊或因災奉旨豁免的稅銀，實收2654萬兩。各部衙辦公費用、官員俸祿等正常開支不必細說，今年朝廷大項的支出有以下幾項：兵部兵工總署開礦山、建工廠、修造戰船槍炮等軍械，各項開支約1000萬兩；舉辦‘射天狼’軍事演習連同護衛聖駕巡幸草原開支約120萬兩；工部治理黃河及漕運開支約700萬兩；朝廷賞賜蒙古各部開支約50萬兩；償付嘉靖二十四年國債利息及部分本金合計300萬兩；戶部雲貴銅政司墊支各項使費100萬兩，合計2270萬兩，這些都是年初即議定或有司奏請皇上明發上諭撥的銀子。亦即是說，今年的各項收支兩抵，再除掉年內各部或有開支，節餘約350萬兩。”
聽著馬憲成報出一連串的數字，朱厚熜喜笑顏開：“真不容易啊！朕記得嘉靖二十二年，朕第一次召開禦前財務會議，你對朕說我大明朝一年收入不過2558萬兩，開支卻高達3021萬兩，一年虧空463萬，各地還有拖欠官員俸祿、提前預征以後年份賦稅寅吃卯糧等等現象。說句心裏話，朕當時嚇了一大跳，真不知道這往後的日子該怎麼過。如今每年朝廷要幹那麼多的大事情，還給官員增加了俸祿和養廉銀，也沒有給百姓增加賦稅，不但能達到收支平衡，還能略有節餘，這是你馬閣老的家當得好啊！”