織田信長的形式標準與其他的大名有很大的不同，雖然這個織田信長也很讚同天皇政治。這一次織田信長做足了準備，其實他的準備就是沒有準備，因為足利義昭是自己扶立上來的。
織田信長攻入京都，在知恩院布開陣勢。幕臣細川藤孝、荒木村重等人見大勢已去，投降了信長。但是不知道武田信玄已經去世的足利義昭據守自己的居城烏丸中禦門第繼續抵抗。信長再次提出和解，但義昭認為信長沒有信用，斷然拒絕。織田信長威脅幕臣以及義昭的支持者，聲稱若不投降，自己將會攻打上京並將此整個地區焚為焦土。同時包圍了義昭的居城烏丸中禦門第。另一方麵，織田信長尋求朝廷的支持，4月5日，在正親町天皇敕命下，雙方講和。
這一下，足利義昭沒咒念了，因為天皇完全的是一個和事佬的形象，所以沒有人可以值得依靠的。所以足利義昭於7月3日宣布背棄和約，在三淵藤英、伊勢貞興以及公家奉公眾的簇擁下逃往南山城的要害槇島城（山城國的守護所）舉兵。槇島城建在宇治川和巨椋池水係交叉處的島上，是足利義昭近臣真木島昭光的居城，為兵家必爭之地。烏丸中禦門第的守軍於3日投降了信長，信長率7萬大軍包圍了槇島城。7月18日織田軍開始攻城，槇島城的建築被破壞，足利義昭以自己的兒子義尋為人質，向織田信長投降。
織田信長一看足利義昭這麼懦弱，動了惻隱之心，他向正親町天皇求了一下情，暫時沒有正式剝奪足利義昭將軍之位，而是在足利義昭投降之後，由正親町天皇下了一道聖旨，將足利義昭永遠趕出京都。而作為勝利者的織田信長則將足利將軍家在山城、丹波、近江、若狹等地的禦料所據為己有。
織田信長被正親町天皇封為天下人，緊接著挾持幕府將軍和天皇支配京都周圍的地區，並充當各地大名紛爭的調停人。放逐將軍後，織田信長保持了天下人的地位，這也就直接宣告了室町幕府已經成為曆史，而織田信長從此開始了統一之路。
此刻，織田信長可謂是誌得意滿，但是德川家康和木下秀吉可犯了難，因為兩個人雖然很支持織田信長的統一大業，但是木下秀吉看出了織田信長的心事，便說道：“主公是不是很在乎大小姐和信康閣下的婚事？”
“猴子，這一點你都看出來了，不愧是我織田家的‘鐮足’（指的是飛鳥時代中期的政治家中臣鐮足）。我正在思考著五德嫁過去，是否能做到守孝道，敬公婆。”織田信長看著似明似滅的燭火，對自己的心腹大將木下秀吉說道。
“主公，五德小姐的品德你我是有目共睹的，自從永祿十年，你將她嫁過去以後，大義之道還是懂得些的，隻不過，他內心跨不過去的坎兒隻有一個。那就是家康殿下的正室築山殿關口瀨名夫人是今川義元的外甥女，而您又親手斷送了今川家的家業，所以這次您把她接回來之後，好好的解釋一下今川家的是是非非，我希望您能夠讓他控製住德川信康。那樣對於織田家將是非常好的。”木下秀吉講道。
“猴子，你設想得非常周到。但是現在戰亂時刻，怎麼把德姬安全的帶回岐阜呢？”信長嘀咕著。
“主公不要擔心，隻要阿閉和朝倉軍被我們滅亡，我相信五德小姐立刻就能回來，畢竟武田家在武田信玄死後已經不行了，所以我們不必要擔心外敵的侵擾。”木下秀吉講出了自己的想法。
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