由於進攻阿閉貞征的軍團獲得了很大的勝利，正親町天皇雖然滿懷著狐疑之情，但還是迫於織田信長和木下秀吉的文韜武略，在丹羽長秀和信長以前的元老級人物柴田勝家的名字裏各取一個字，將木下秀吉賜姓羽柴，織田信長被提拔為攝政（侯爵級攝政，官爵正四位）。
1574年1月、攻下朝倉氏後，越前雖成為織田家領土，但地頭武士與本願寺門徒卻掀起叛亂，富田長繁在一乘穀殺害了守護代前波吉繼（桂田長俊）。接著呼應此叛亂，甲斐的武田勝賴也出兵攻打東美濃。信長決定與信忠一起迎擊武田軍，但在信長援軍抵達前，東美濃的明智城已被攻陷，信長為避免與武田軍正麵衝突而撤退到岐阜。
可是信長總有一種預感，原來的武田家的戰鬥力似乎被削弱了一半，因為這一次戰鬥雖然有驚無險，但是可怕的是自從武田信玄死後，武田勝賴所率領的武田家，總有一種如履薄冰的感覺，這讓喜歡打閃電戰的織田信長有時候找不到北。
信長看到武田家的這種狀況，明白滅甲斐國並不是一朝一夕的事情，那得是需要五年的削弱，最後還得需要五年的殲滅戰鬥才能完成。所以此刻信長並不太注意武田家的一舉一動，而這個時候他要注意的是本願寺顯如。
3月，信長上洛並受任從三位、參議的官位。信長奏請正親町天皇表示欲收割蘭奢待（一種高級香料）。據言，這是信長為了讓各國知道信長與正親町天皇之間有密切關係所采取的行動，天皇則也下了勅令允許之。
信長被委任為參議的位置，說明了天皇在大部分的時候還是支持織田信長，隻不過織田信長不喜歡被權力所束縛的生活。各國大名知道信長的實力為朝廷所承認，尤其是從奧州派往信長處表示友好的使者也增加了。
信長看到這樣的情形以後，並沒有給士兵們和手下大將以休息的時間，而是急行軍在四個月後來到了伊勢長島，在那裏和自己的弟弟織田信廣展開了搏鬥。7月，信長率領3萬大軍，從水陸路方麵完全包圍了伊勢長島，切斷了敵方兵糧補給。在一揆軍巧妙的戰術下，擊殺了信長同父異母的弟弟織田信廣。但8月後一揆軍陷入兵糧不足的狀況，在織田軍猛攻下大鳥居城也被攻陷一揆軍超過1000人以上戰死，戰況因此更往織田軍有利的方向發展。
一向一揆的實力此刻還是很強勢的，所以信長這個時候還是不能和他們掄圓了打，因為如果真的掄圓了打，信長這邊的力量也會有很大的削弱。
9月29日，兵糧缺乏的長島城門徒投降，並向信長請求讓其搭船從大阪方麵退兵，信長亦接受之。然而信興、信廣等備受信長信賴的兄弟被殺害，加上一揆軍的退卻速度遲緩，於是信長下令鐵炮同時射擊搭船的門徒。一揆軍方麵亦被激怒，有一部分反過來襲擊織田軍，此時信長之弟織田秀成等人戰死。接下來信長針對困守中江城、屋長島城的長島門徒，從城堡周圍開始包圍，最後攻破之。此時，據傳一揆軍有2萬人為織田軍所殺害。經此戰後，信長成功地平定長島門徒們的叛亂。
此刻，本願寺顯如被逮捕歸案，信長也知道這位宗教領袖的地位還是得保持一下，所以將自盡改為流放，流放的年數變為三十年，因為他知道，再過三十年，日本很可能是一個大的盛世。
信長的這一招著實止住了林秀貞的異議，但是明智光秀卻沒有停止他的活動，在殺死朝倉義景之後，他開始了自己的惡毒計劃。因為他有一個非常要好的朋友——馬場信房，但這個朋友卻被本多忠勝所殺，所以隻要是德川家有難，織田信長必然幫助，到時候，織田信長不死也得死。
就在這個時候，織田信長明白明智光秀有不臣之心，所以故意提防著明智光秀。明智光秀也百思不得其解，因為自己的異心隱藏的很隱秘。就在明智光秀發愁的時候，甲斐武田氏發出了和平信號。