徐延翰在仙居縣的前任縣令史文進總算走得早，雖然逼死舉人馬真也有他一份，但他於乾隆四十四年就離開浙江了，僥幸逃過一劫。
徐延翰原在仙居縣的頂頭上司、台州知府徐士鑾撤職拿辦，交刑部議處。
劉錄勳“顯係回護黃梅，阻撓欽差調查，且在任時亦有不檢行為”，一並交刑部議處。
孟衛禮因禍得福，並不在浙江一案處理的官員之列，隻以私藏官物的罪名，沒收贓物，降一品。
文中未出現的浙江溫處道道台張裕穀、糧道道台鄭雲，唯福崧之命是聽，暗中監視竇光鼐，且添油加醋，以不實之言上報，迎合上司。所作所為，有礙公正，不合官體，著革職交吏部議處。
按軍機處合議：黃岩縣知縣許文成、永嘉縣知縣馮萬行故意隱瞞虧空，特別是馮萬行，借了漕銀填充銀庫，騙過欽差，實屬可惡。許文成罰議罪銀子兩萬兩。馮萬行本應重懲，但其祖父馮實齋乃兩朝重臣，就是乾隆也一直對其極為推崇，看在其祖父的麵子上，也罰銀兩萬。
這些中下級官吏一個個入獄、流放、撤職，那麼浙江案中的高級官吏和後台極硬的官員又是怎樣的情況呢？
第二任欽差，級別最高的阿桂，在乾隆明發諭旨訓斥之後，革職留任，撤軍機首領大臣之名。但其軍機大臣和大學士管理刑部事務的職務仍然保留，阿桂依然是手握重權，乾隆還是要重用阿桂。不過，經此一案，阿桂在軍機處的地位畢竟有所下降，和珅撿了個大便宜，地位大大上升，已經與阿桂不相上下了。
和珅的弟弟和琳也在此案中得到大實惠，乾隆下旨誇獎道：“和琳雖官職卑小，但此次查案，甚為公正，且頗幹練，終使案情大白於天下，實應嘉獎。”和琳便由工部從五品給事中升任正四品杭州織造，這是個肥得流油的好缺，亦是顯示才能加官晉爵的跳板，和琳從此走上飛黃騰達之宦途。
第一任欽差曹文植，革職留任。副欽差薑晟罰俸半年。
原浙江巡撫福崧，罰得最重。正二品的山西巡撫是當不成了，被革去頂戴花翎，交吏部議處，回到京中後被任命為有職無權的正四品二等侍衛。
福崧的心腹、浙江布政使盛住，後台相當硬，是阿桂和十五阿哥永琰，因此軍機處並未對他怎樣，隻是革去頂戴花翎，調入京中聽用。不久，他被任命為工部右侍郎，仍是從二品，權力也是很大的。
最不可思議的是浙江巡撫伊齡阿。乾隆專門下旨嚴厲訓斥：“伊齡阿對竇光鼐先存成見，因此對黃梅便有了袒護之心。偏聽下屬之言，不察虛實，遽行參奏。又顧慮嚴查黃梅會累及前任福崧，存官官相護之心，而對浙江之案置若罔聞，不能複膺封疆之任。”伊齡阿聽罷聖旨，以為大禍臨頭，不知自己會是什麼結果。哪知乾隆竟下令，調伊齡阿進京任總管內務府大臣，官居正二品，竟比從二品的巡撫還升了一級。伊齡阿又驚又喜，急忙叩頭如搗蒜一般道：“皇上高厚矜全，實為臣所夢想不到。奴才到京後，唯有事事小心，竭盡血誠，勉勤職守，以期仰報鴻慈以萬一。”
第三任欽差，江蘇巡撫閔鶚元算是浙江虧空案中最倒黴的高級官吏了。雖然他在處理此案時，比較秉公持正，並據實上奏。但麵對此案中涉及到阿桂的情節，卻不敢觸動這位通天的高官，審得含糊，奏得曖昧。乾隆以其“並未對阿桂原審不實之處附折參奏”之過，交吏部議處，乾隆朱批道：“阿桂原審如無過錯，朕又何必再派你去重審？”閔鶚元兩頭受氣，雖然最後隻是讓他寫了個謝罪折子，但也將他氣得夠嗆。
福岜是浙江按察使，是管理刑名、司獄和囚犯的。明麵上與此案幹係不大，因此仍留任原職。
跟隨竇光鼐辛苦查案的幾位功臣，並未得到應有的獎賞。
王義錄仍是正六品門千總，不過是授了實職，帶了兵。
李大鼎由浙江正五品學政副使調任京官，任命為從四品光祿寺少卿。