2.監督內容的代表性問題。互聯網的出現提升了人民群眾監督政府的意願與積極性。不受年齡、階層、地域等因素的限製，任何人都可以通過網絡監督政府的行為。在這種廣泛的監督模式下，網民可以對自己感興趣的監督內容表達意見，可以是個性也可以是共性的問題。在對個性問題進行表達時，如果對內容進行一些修飾，可以吸引大量網民的目光，形成巨大的輿論壓力。比如網民在網絡上刊登某機關上班打遊戲的圖片，但在網民的參與下，最後形成一種政府機關普遍存在上班打遊戲的網絡輿情，導致政府不得不將其作為共性問題來處置以回應網絡輿論，這無疑不利於監督的有效性。
3.監督的非理性問題。以網絡為手段的監督方式，網民針對政府的施政行為，可以無所顧忌的發表自己的觀點，其中具有理性客觀的意見，也有非理性的情緒發泄。在當前網絡對政府負麵偏好較為嚴重的情況下，網絡監督呈現出明顯的非理性化，許多網民對政府作出的任何決策都是采取攻擊的態度，網絡跟帖中充斥著反對之聲。而當網絡曝光政府的負麵信息時，這種聲音將得到極大的釋放，很多網民盲目地反對、謾罵、諷刺和調侃聲，中肯的意見、建議等理性的聲音被完全淹沒。這種監督方式和傳統的以信函、電話等方式直接監督或通過廣播、電視、報紙等傳統媒體間接監督的方式有很大的不同，政府無法準確的收集、采納有用的監督意見。因此，一旦網絡監督突破了理性的界限，情緒化、攻擊性網民觀點將削弱監督針對性和有效性。
三、網絡監督對政府施政的幹擾性
網絡監督缺乏相應的法律和製度，監督意見的真實性、代表性和理性程度也存在一定的缺陷，網上監督的不足之處也會直接反映到網下政府施政的整個過程之中。從政府針對經濟、社會發展做出的重大戰略決策部署，到市容管理、環境保護、拆遷征地等具體的行政行為，再到公檢法等司法機關對案件的審理，都會受到網絡監督負麵影響的幹擾。
1.影響重大戰略決策部署。網絡監督是政府科學決策的重要組成部分，有助於推動政府決策的科學化、民主化水平。網絡輿論是政府決策需要考慮的重要因素，但不是決策的決定性因素。各級政府對本地區經濟社會發展作出決策時，會從全局和長遠利益出發，並有專業人員進行科學論證，決策可行性、科學性、專業性水平較高。而部分普通網民由於缺乏專業知識和過分關注局部和短期利益，會質疑或反對政府科學決策。這種觀點受到網絡關注並形成一定的輿論聲勢後，必然會對政府的決策產生影響。在網絡輿論的強烈反對下，政府決策麵臨兩難境地。如果政府堅持原來的決策部署，必然引發網民對政府無視民意的不滿；如果政府對原有決策作出更改以滿足個體利益，則可能會增加決策的成本，影響全局和長遠利益，甚至因決策時間拖延而錯過最佳的決策時機。
2.影響具體行政行為。當前，互聯網的發展前所未有地強化了人民群眾對政府行政行為的監督。但網絡上頻頻曝光的政府強拆征地、暴力執法、環境汙染事件，則不斷刺激著網民敏感的神經。在部分網民心目中逐步形成了對政府的負麵“刻板印象”，對政府的行為一般持固定的反對態度，這導致了政府合理的行政行為可能被誤認為是違法行為，從而遭到網絡輿論的無端指責。比如拆除違建過程中產生的糾紛，網民將相關信息傳至網絡後，由於對政府負麵“刻板印象”和對弱者的同情，網絡輿論容易一邊倒的指責從而幹擾政府正常的行政行為。堅持原則還是順從“民意”是政府需要麵對的難題。