（1）視診：觀察肛門局部的皮膚色澤及形態。可見膿腫處紅腫熱痛，不可觸摸，將潰時變為白色。破潰後膿汁厚稠、色黃、量多者，多為金黃色葡萄球菌所致的急性炎症；而混有綠色膿汁者，多為綠膿杆菌感染；膿汁色黃且臭者，多為大腸杆菌感染；膿色清稀或如豆渣樣，多為結核杆菌感染。若膿血相雜，似果凍狀物，應考慮為癌變。
（2）指診：對確定膿腫的形態、性質、位置、有無瘺管、瘺管走行如何、膿腫涉及哪個層次、有很重要的意義。
（3）探針及著色檢查：可以確定膿腫感染的內口，以及膿腫範圍、瘺管走向。
（4）內窺鏡檢查：觀察直腸內有無內口、膿血及其他病變。
（5）膿汁培養及活體組織檢查：確定致病菌和病變的性質。
3.致病菌的診斷和認識
現代醫學認為，感染是引起肛門直腸周圍膿腫的主要原因，而外傷、腫瘤等也能導致肛門直腸周圍膿腫。
（1）感染因素：肛門直腸周圍感染，譬如，肛竇炎引起的肛門周圍膿腫、肛裂感染、痔感染、會陰部手術感染（痔注射或手術後感染，產後側切後感染，前列腺、尿道手術後感染等）、尾骶骨骨髓炎或結核等。
其次為肛門周圍皮膚的疾患，諸如，化膿性汗腺炎、毛囊炎、肛門腺炎、蜂窩組織炎、粉瘤、尖銳濕疣、平滑肌瘤、血管瘤感染等。
另外，結核病、潰瘍性大腸炎、克隆氏病、糖尿病、白血病、再生障礙性貧血等全身疾病也能引起肛門直腸周圍膿腫。
（2）外傷因素：槍彈貫通傷、刀等銳器刺傷、直腸肛門內異物損傷等。
（3）腫瘤：肛管直腸癌破潰或波及深部、平滑肌瘤、血管瘤、脂肪瘤等感染，骶骨前畸胎瘤等。
（4）其他因素：性病性淋巴肉芽腫、放線菌病、直腸憩室炎等感染。
4.肛門直腸周圍膿腫的原發病灶的診斷
膿腫原發病灶的尋找，是對肛門直腸周圍膿腫能否根治起著關鍵的作用。
（1）擠壓法：即采用分葉狀肛門鏡擴張暴露膿腫部位的隱窩，然後壓迫膿腫，以觀察膿汁排出之所在，即可確定內口。
（2）雙合診：把食指插入肛管，拇指在皮膚觸摸，膿腫波動最明顯的皮膚及黏膜最薄區，即是內口、外口的位置。
（3）肛門鏡檢查：可見肛隱窩局部充血，可有膿性分泌物。
（4）探針檢查：在肛門窺器下，用探針鉤隱窩，較易進入，且有溢膿者，即為內口。也可在術中，切開引流時探及內口。
操作中要切忌暴力，以免造成人為的假內口，致使手術失敗。
5.肛門直腸周圍膿腫的分類
共有三種分類法：
（1）六類法：主要根據膿腫形成的部位分。
①皮下膿腫：在肛門周圍皮膚下麵形成的膿腫。
②黏膜下膿腫：在直腸黏膜下層內形成的膿腫。
③坐骨直腸窩膿腫：在坐骨直腸窩形成的膿腫。
④骨盆直腸窩膿腫：在骨盆直腸窩形成的膿腫。
⑤肛門後膿腫：在肛門後間隙內形成的膿腫。
⑥直腸後膿腫：在直腸後間隙內形成的膿腫。
（2）二類法。
①高位膿腫：位置在肛提肌以上的膿腫，如骨盆直腸窩膿腫，高位肌層膿腫、高位黏膜下膿腫等。
②低位膿腫：位置在提肛肌以下膿腫，如坐骨直腸窩的膿腫、皮下膿腫。
（3）急慢性分類法：即根據膿腫的性質和致病菌來分。
①急性化膿性膿腫：多為金黃色葡萄球菌、大腸杆菌所引起。
②慢性化膿性膿腫：多為結核菌引起。
三、望診球結膜血管診斷內痔的原理及方法
望診是中醫學寶庫中的重要遺產，由於在運用中，難以量化、定性化，使得望診難以推廣。
1.五輪、八廓
望診球結膜血管診斷內痔，其理論依據是五輪、八廓學說。
（1）五輪：即指眼睛的構成是由五髒精華之氣孕育而成，故將眼部分成五輪——風輪、肉輪、氣輪、血輪、水輪。取其圓為五輪，能夠靈活轉運之意。五輪內應五髒，髒有所病，必須於輪，故輪屬標，髒屬本。五輪和五髒的分屬：肝屬木曰風輪，在眼為青睛；心屬火曰血輪，在眼為眥；脾屬土曰肉輪，在眼屬上下胞（眼瞼）；肺屬金曰氣輪，在眼為白睛；腎屬水曰水輪，在眼為瞳仁。