在診斷時，急性回腸克羅恩病易與急性闌尾炎、急性出血性小腸炎等急腹症混淆。本病與潰瘍性結腸炎有時不易鑒別，近年來統計，有IBD病例的病理切片中亦有5％～10％病例尚難確定診斷。克羅恩病也不能根據有無肉芽腫而定。因為少數克羅恩病可無肉芽腫，而且其他腸道慢性炎症（潰瘍）亦可有肉芽腫形成。診斷本病時應排除其他腸道感染病變、血管病變和腫瘤等，如細菌性痢疾、阿米巴痢疾、腸結核、血吸蟲病以及由其他病因引起的腸炎、結腸癌、小腸淋巴瘤、肉瘤、類癌、慢性腸道真菌感染與腸型白塞病。此外，還應排除其他可以引起腹痛、腹瀉、便血和腸梗阻等有關疾病。
三、治療
因為本病病因不明，目前尚無特殊療法。一般采用支持療法和對症治療。有活動性病變者，應臥床休息，給予合理的生活指導和精神鼓勵，避免患者精神緊張、煩惱等不利因素，並注意加強營養、糾正代謝紊亂、改善貧血和低白蛋白血症。以前強調低脂肪、少渣飲食，但這種飲食反而影響患者的食欲：而可口美味的食品使體重不再下降，實際上更有益於身心健康，這與高營養、高維生素和易消化的原則並不矛盾。宜補充多種維生素、葉酸以及鐵、鈣等無機鹽，有時還應補充鋅、銅和硒等元素，這些物質是體內酶類和蛋白質的組成成分，具有保護細胞膜的禦毒作用。對嚴重病例，必要時可輸血、血漿、白蛋白及複方氨基酸，甚至給予要素飲食或靜脈內全營養。解痙、止痛、止瀉和控製繼發感染等也有助於症狀緩解。可應用阿托品等抗膽堿能藥物，但應警惕誘發腸梗阻的可能。複方苯乙呱啶、洛呱丁胺（易蒙停）有時亦可減輕腹瀉。