巴斯德先在一個死去的男孩的身上分離出了狂犬病的病毒，然後又小心翼翼地在動物身上進行了接種實驗。這一次巴斯德又成功了。當巴斯德經過千辛萬苦終於製成了狂犬病疫苗的時候，已經是1885年了。巴斯德當眾明確宣布，他已經可以治好有這種病的動物，可以讓它不再發病了。巴斯德製成的狂犬病疫苗不僅可以防止人們被動物咬傷後得這種病，而且還可以用這種疫苗治好已經被動物咬傷，得了狂犬病的人了。
接受巴斯德用免疫方法進行治療的第一個病人是9歲的小男孩梅斯特。
這是一個勇敢的孩子，當一隻瘋狗向孩子們衝過來的時候，他挺身而上和這隻狗打了起來，使其他孩子都脫離了險境。當他被送到巴斯德麵前的時候，真是悲慘極了：他的手上、腳上、腿上到處都是傷口，別的醫生都認為已經任何沒有希望了，但是，巴斯德還是抱著試一試的心情收下了這個可憐的孩子。
巴斯德先給梅斯特注射了具有最輕微的毒性的菌苗，然後逐漸加大疫苗的新鮮程度。因為越新鮮的菌苗危險性越大，因此，巴斯德耐心地、緩慢地進行著這項令人懸心的工作。他第一次注射的是14天前的菌苗以後就一天一天地往前提，最後一次，他給梅斯特注射了僅僅死去了一天的動物身上取得的菌苗，真是太危險了！但是，這一次巴斯德又勝利了，小梅斯特終於恢複了健康。後來他就當上了巴斯德的看門人，終生留在了巴斯德的身邊。
由於巴斯德終於攻克了治療狂犬病的難關，他一下子就成了全世界唯一能夠治療這種可怕的疾病的專家。於是，幾乎全歐洲的病人都給巴斯德送了來。從1885年7月——1886年10月，在一年多的時間裏，巴斯德先後一共治療了2500多個狂犬病人，治愈率高達百分之九十九以上。據洛伊斯·恩·瑪格納統計，從治好第一個狂犬病人到1935年為止，巴斯德研究所先後共治療了51057個病人，其中有151人死亡，失敗率不到百分之一。
在巴斯德治療狂犬病的記錄中，有過一次影響最大的病例。
當時，巴斯德治療狂犬病的工作剛剛開始不久。有一天，人們一下子給他送來了19個俄羅斯人，他們都是被一隻非常可怕的狂犬咬傷的，傷勢都很嚴重。巴斯德立即投入了緊張的治療工作。盡管這些俄國人傷得十分嚴重，而且從俄羅斯跑到法國巴黎，已經耽誤了最好的治療機會，但是，巴斯德使用他的注射狂犬病疫苗的方法，仍然成功地治愈了其中的15個人。這在當時是不可想象的，就好像今天一個高明的醫生一下子治好了15個晚期的艾滋病人一樣，是一個真正的奇跡。
這15名被巴斯德治好了的俄羅斯病人在返回家鄉的路上對巴斯德的功績進行了狂熱的宣揚，這15個病人的返鄉之行不像是一次長途跋涉，卻更像是一首慶祝巴斯德向科學進軍取得勝利的頌歌。這一行動就足以使偉大的巴斯德名垂青史了。
為了表彰巴斯德的功績，俄國沙皇給了巴斯德100萬金法朗，法國的巴黎建立了著名的巴斯德研究院。在捐贈慶典上，法國國家軍樂隊高奏了宏渾的凱旋樂，法國國家元首親自向他授與了大十字勳章。這是不可想像的榮譽，是打了大勝仗的高級將領才能享受到的最高的榮譽，是隻有拿破侖才能得到的榮譽。
在榮譽麵前，巴斯德顯示了一個偉大科學家的高尚品質，在授勳儀式上巴斯德堅持：功績不是他一個的。並使他的助手和他一起分享了這個榮譽。
巴斯德於1895年去世，他留下的名言是：“在觀察的領域中，機遇隻偏愛那些有準備的頭腦。”