天亮後，從通報中得知，兵團主力在昨夜攻擊鼓浪嶼，稍後又發起對廈門的登陸戰，經過一夜激戰已經獲得成功。但由於敵人反撲，組織鞏固和擴大登陸場的戰鬥還在繼續。
16日上午，敵軍飛機和軍艦一起出動，向嵩嶼及九龍江下遊地區大肆轟擊，企圖阻止解放軍的進攻，特別是其軍艦有進入廈門港支援廈門作戰的企圖。
師部當即命令炮兵對準敵艦進行射擊，迫使敵艦不敢靠近廈門和鼓浪嶼。
解放軍八十五師參謀長吳森亞站在鬥門至安兜公路邊的墳堆上，看到前麵丘陵地上有一群黑壓壓的人影在晃動，前麵是逃跑的敵人，後麵是拚命追擊逃敵的解放軍二五五團某分隊。
再往左看，也是一片黑壓壓的人群，自北往南移動著，那是二五四團在追擊敵人。
兩個團在安兜會合了。
吳森亞獲悉，二五四團兩個突擊營登陸不久就遇到敵人炮火的阻擊，很多戰士受傷犧牲了。而二營、三營快速衝向高崎與湖蓮間的灘頭，避開了*，炸開了三道鐵絲網，占領了突破口。
二五四團二營、三營擊退了敵人的兩次反擊，並向飛機場東部進攻，擊毀了敵人的坦克。
二五四團二梯隊一營向高崎東側突破。
在他們從側後向高崎攻擊的時候，恰好與逃跑的敵人遭遇，雙方交戰片刻，便繳獲了逃敵的槍械。
後來，又有人報告吳森亞，左翼二五六團也開始登陸了，但在鍾宅墩和上、下馬一帶被敵人圍住了。
吳森亞從獲得的情報分析，必須立即擴大登陸場。於是立即命令：二五四團派一部和二五五團三個營前往支援二五六團，以便控製安兜東部。
二五五團主力打到江頭及其以東後埔、蔡塘一線時，敵人卻利用中部一帶的高地，背靠大山，憑借堅固的工事進行垂死掙紮，解放軍一時難以攻克該地。
吳森亞思慮著，他覺得應該鞏固已得的陣地，擴大登陸場，隨時做好準備抗擊敵人的反衝擊，待命協同三十一軍進攻雲頂岩。
吳森亞一麵命令部隊立即停止前進，一麵召集兩個團的領導到安兜指揮所開會，商討下一步作戰的方案。
吳森亞在會上提出了自己的看法和主張：
主要任務是迎擊敵人的反擊，做攻守兩手準備；調整部署，二五五團就地構築工事轉入防禦，如敵反擊，必須堅決頂住。
二五四團為預備隊，一營在園山修築工事集結待命，二、三營集結於飛機場南端、安兜東北地區休整、吃飯，準備隨時出擊。
兩個團有六千人，即使敵人大部隊壓上來，也可保證守得住，堅持到晚上，後續部隊必能上來協力出擊。如敵人的反擊被打垮，我軍可乘勢立即跟蹤追擊。
對於吳森亞的建議和主張，大家都表示讚同。
會議結束後，吳森亞馬上把剛才的會議決定和作戰部署向兵團司令部作了彙報。
整個16日上午，解放軍已經將登陸場擴大到島北地區，開始向市區進攻。
到了下午兩點，敵人的陣地沒有什麼動靜。
這時吳森亞判斷敵人已經有了逃跑的想法，決心主動出擊。於是，又把兩個團的領導再召來商議。
吳森亞又重新作了如下部署：
一個團打正麵，一個團打迂回，互相策應。
二五五團的任務是從正麵向洪山柄、雲頂岩、自來水廠、廈門大學之線攻擊前進，並保障二五四團迂回安全。
二五四團的任務是從安兜經蔡塘向前村、石胃頭、黃盾、溪頭、曾後攻擊前進，進行迂回，策應二五五團正麵進攻，並斷敵海上退路。
吳森亞的命令下達後，兩個團便展開了積極的行動。
吳森亞又囑咐說，發起戰役的時間不能晚於下午3時。
這時，吳森亞又接到葉飛司令員的電話。
葉飛司令員在電話裏急切地說：“敵人已經打算離開廈門，他們為爭奪船隻而互相殘殺，你們要馬上行動。”