王恩洋在《起信論料簡》中提出了出人意料的怪論，他用唯識思想評論說：經不但不是馬鳴的著作，也不是佛教的思想，而是依附外道的邪說。他說："自來相似正教諸偽經論雖無量種，而流行最廣，立意最乖者，《大乘起信論》一書為最"。他還認為："斯論之作，固出於梁陳小兒。"這種徹底否定《起信論》的佛學價值的說法自然遭到人們的非議。陳維東批評王氏的說法是"不信大乘佛法，謗起信大乘論"的小乘及外道。唐大圓指責說："考證隻就曆史說馬鳴無其人與《起信》偽作，不過經生考據氣習，稍解佛理者，一笑置之而已"。宋培更譏之為："善於吹毛求疵，以非疵為疵，徒費心機"、"其不知求人之疵，正是示己之疵也"。
學者們雖然認定《起信論》是偽作，但對其在佛學上的地位與作用仍給予極高的評價。梁啟超說："《起信論》者，消化印度的佛教而創成中國的佛教一大產物也"，"此書實人類最高智慧之產物，實中國、印度兩種文化結合之晶體，""巍然成為世界學術界之一重鎮。"印順法師還肯定說："無論是中國或印度造的，它所代表的思想，在佛教思想中，有它的獨到價值，值得我們深深的研究。"
近20年來，由於眾所周知的原因，佛教與其他上層建築一樣，受到殘酷摧殘，《起信論》的真偽之爭議，自然無法繼續開展。現在，隨著黨的宗教政策的落實，可以預料，這個問題必將會得到令人滿意的結論。