在崇禎九年離開離開天津衛碼頭後，方以智和鄭芝鳳率領的船隊，在雇請的葡萄牙船長和水手的駕駛下，掉頭南下，並於二十天後駛入了中國南海，沿著當年鄭和下西洋的路線一路向西行駛。
由十艘大船組成的船隊航行近兩個月後，穿過了馬六甲海峽，駛入了浩瀚無邊的印度洋。
在經過了這兩個多月的船上生活後，船隊中四百名錦衣校尉以及數百名皇莊收留的孤兒，還有幾十名負責照料這些孩童的太監，從最開始滿是興奮和激動的心情，到現在的後悔和想家，大部分人的情緒已是完全翻轉了過來。
船隊在大明沿海航行時，由於風浪較小，這近千人的隊伍中隻有少數出現了暈船的現象，其餘的大部分人並沒有什麼太大的反應，後來在泉州港補充過物質後，方以智還讓眾人上岸休息過一個時辰，大夥兒的心氣還是很足的，都對未知的世界充滿好新鮮和好奇。
但是在進入南海之後，風雲突變，在經曆過一次風暴洗禮之後，雖然船隊安然無恙，但八成的人已是嘔吐的站立不住了，很多人內心的恐懼感也開始加大。
好在自那之後的航程還算安穩，沒有再遭遇到太大的風浪，暈船的人很快便恢複了正常，原本的擔心和害怕也在逐漸消失。
進入印度洋之後，壯麗無比的大洋景色再次讓人們重燃鬥誌，看到碧藍如洗的天空下，一望無際的藍色海水，水麵上不時躍起的各種不知名的魚類，不管是錦衣校尉還是那些孩童們都是雀躍不已。
在葡萄牙船長請示過方以智和鄭芝鳳後，船隊在馬尼拉港再次停靠休整，並補充後續的淡水以及其他生活物資。
馬尼拉港的西班牙人對這隻大明船隊的到來表現出了深深的敵意，也就是在看到船隊懸掛的鄭家認旗後，才勉強同意船隊暫時停泊修整，隨後總督府便派來武裝士兵監視著船隊，並禁止無關人等上岸休息，鄭芝鳳一怒之下本待下船與其理論，但被方以智給製止住了。
方以智的理由很簡單，他們此行的目的不是來和別人幹架的，到達歐洲，並把聖上交代的差事完成才是最緊要的，至於西班牙人的這種無理舉動，等回返後上稟即可，相信聖上和朝廷自有論處。
在花費了比別人更高的價格補充完給養後，船隊隻在馬尼拉港駐留了四個時辰便拔錨起航，再次駛入了廣袤無垠的印度洋。
遵從朱由檢的旨意，除了正常的靠岸補給外，方以智和鄭芝鳳並未在沿途的小國多做停留，沒有像當年的三寶太監一樣到處宣揚大明的強盛和文明，他們隻想著後麵還有更重要的使命需要完成。
如果順利完成皇帝交辦的差事，他們的名字將會如三寶太監一樣，被銘記在青史之上。
因為他們即將走的是在華夏曆史來說，一條前無古人的道路。
一百多年前三寶太監下的其實是南洋，而他們將會比前輩走的更遠，這次他們才是真正的下西洋。
方以智和鄭芝鳳年齡相仿，因為這次從未想到的任務，兩個平時素未交集的人走到了一起。
如果不是朱由檢穿越過來，在前世的曆史中，別說共事了，兩個人根本都不可能知曉對方的名字。
在經過最初時的互相輕視和禮節性的客套後，隨著時間的延長以及航路上的寂寞枯燥，同在領航船上的兩人之間，接觸和交流也慢慢多了起來。