趙頊事先並沒有想到他的機智而又帶孩子氣的決定的意義：由阿雲一案引發的爭議，是王安石向舊的政治秩序發起的第一次衝擊，也是司馬光在與王安石的第一次較量中落敗。王安石的“按問自首”一經提出，——確切的說是由許遵提出經王安石認同，如一塊巨石投進了平靜的水池，頓時掀起軒然大波，大理寺、審刑院、刑部內吵成了一鍋粥。有的大罵王安石是異端邪說，足以亂政，獨有大理寺評事崔台符一拍桌子，雙手高舉，哈哈大笑說：“數百年來誤用刑名，今日方得厘正！”此次爭論持續了半年之久，範圍已擴大到朝中的各個部、院，直到熙寧二年二月，當時的禦史中丞滕甫上表請再選官定議，趙頊下詔由翰林學士呂公著（呂公著已經從禦史中丞改授開封府知府又改授翰林學士）、韓維和知製誥錢公輔重定，結果是三人讚同王安石的意見。大理寺法官齊恢、王師元、蔡冠卿又上表劾呂公著等所議不當，趙頊又下詔由王安石和法官們集議，彼此反複論難，久而不決，趙頊隻得再下詔：今後謀殺人自首，並奏聽敕裁。也即是說，今後遇到這類案件，由皇帝聽斷。
朝政明麵上依然是四平八穩，各部、院大臣仍然是按律、例、條、令視事，但沒有人能夠否認，身為翰林學士的王安石已經給政壇帶來了一股新風（自然也有人說邪風）。《六經》這一士子們用以安身立命，用以修身齊家治國平天下的經典，王安石居然能用審視的目光指陳它的錯誤。大臣中固然有人撇嘴嗤鼻，但王安石的話又無可辯駁，並且趙頊連連喊好，讚不絕口。
王安石邇英閣講經，還有一個插曲：先是呂公著上書，說，早前，侍講者皆賜坐，自乾興以來，講者始立，而侍者皆坐聽。臣等竊以為侍講者宜賜坐，韓維幾個人連忙上表附和，說，宜按天禧舊製，以彰陛下稽古重道之意。這意見一出，劉攽等人上表反對，理由是自從乾興以來，已曆仁宗、英宗兩朝，行之五十年，不可輕議言改。趙頊對王安石說：“卿可坐著講。”但王安石沒有坐。後來，禦史們反以此作為王安石的一條罪狀，說他要坐著講經，這是“慢上”。
阿雲一案的議定，“按問自首減刑兩等”的提出，是對舊的刑律的修訂，或者說是對祖宗所定法製的質疑和否定。大臣中一片嘩然，支持的和反對的都不少，有點勢均力敵。趙頊認同王安石的意見，他忽然覺得他與王安石之間有很多相通的東西，他們不是不問是非的對祖宗和曆史頂禮膜拜，而是以俯視的角度審視的目光予以剖析。他不明白作為皇帝如何才能拱手南麵，垂衣裳而治，但他已朦朧的覺得王安石的“治道”更適合他。
時光如汴河水，汩汩流逝。又到了西風摧綠、鳴雁呼歸的季節。這一天，趙頊在崇政殿批閱奏折，看了幾篇，微微一笑，令在一旁侍駕的張若水去召曾公亮前來議事。
今天趙頊的情緒很好，曾公亮到時，趙頊正在崇政殿裏慢慢的踱著，他的心情隨著思維暫離奏折，淩空飛舞。曾公亮行過常禮，趙頊說道：“公亮來了，賜坐。”曾公亮因趙頊站著，並沒有就坐。趙頊說道：“韓絳上表舉薦王安國，說是材、行皆可。你以為如何？”
曾公亮說道：“王安國是王安石的二弟，曾舉茂才異等，當時所獻《序言》，翰林院考為第一。因母喪廬墓三年，沒有入闈參試進士。臣也以為韓絳所薦甚當。”
趙頊說道：“既如此，朕就賜王安國進士及第，去國子監當教授吧。”
曾公亮說道：“陛下處置極當，臣即令舍人院出告。”
這是一個極輕鬆的話題，曾公亮本與王安石交好，既有韓絳舉薦，自然要送一個順水人情。趙頊停止了踱步，轉身看著曾公亮說道：“西夏自諒祚死，遣薛宗道來我朝告哀之後，兩國各守疆土，再無幹犯之事。韓琦上書請歸相州，朕主意未定。依你之見，韓琦授何職為是？”
趙頊說起韓琦，曾公亮先是一愣，隨即說道：“韓琦乃社稷重臣，因王陶劾而歸相州，又因邊事而安撫陝西，今兩國交好，邊境更無戰事，臣以為韓琦宜回中書視事。”
趙頊“嗯”了一聲，深深的看了曾公亮一眼，這才說道：“朕聞人言，卿與韓琦不和，必阻韓琦回朝，如此看來，此話不確。”
曾公亮說道：“臣和韓琦同為執政，獻言廟堂，畫策中書，臣不才，如何與韓琦不和了？陛下，流言不可信。韓琦調永興軍執掌兵權，還是臣保舉的。”
趙頊說道：“韓琦是不會再回中書了。”稍頃又說，“也罷，朕準韓琦複回相州，即令舍人院出告吧。”