維摩堂辯論的勝利，使得鑒真在日本僧界的地位得到鞏固。
天平勝寶八年，即公元756年的五月二十四日，鑒真則被孝謙天皇委任為東大寺別當的“大僧都”（位次於“僧正”，大僧都是僧都中的最高級別），隨鑒真東渡的弟子法進也同時被任命為“律師”（日本僧官級別之一，位次於“僧都”）。同年六月，又敕令以太上皇的待遇，供給大和上的禦用米鹽，永賜為“祖師”。
於是四麵八方前來學律的人更多了，可是人數實在太多，沒有多餘的地方安置他們，所以很多人都是來也匆匆去也匆匆，聽了一兩次課，湊合了一兩個晚上就又回去了。這件事情被天皇聽到後，憂心忡忡。以前沒有主動學律的僧人，現在倒好了，學律的人太多，熱情不減，卻沒有地方招待，冷了他們的心，這可如何是好？
天皇把這件事說與幾位大臣聽，有位大臣為天皇寬心：“陛下，此事並非難事。當年陛下隆恩，賜給新田部親王的宅子現在空著，久無人照料，已經生了雜草，依我看不妨就在親王的舊宅的基礎上建造一座寺廟，以供養四方僧人。陛下您意下如何？”孝謙天皇聽了之後大喜。
同年，聖武太上皇病重，鑒真被請去會診。此前，鑒真為光明皇太後治過病。大和上醫術高明，療治皇後有不豫之功。當時日本人對於中藥還不大熟悉，隻有鑒真能夠辨別。大和上後來在日本大力弘揚張仲景的《傷寒雜病論》，在此基礎上，大和上自己撰寫了一部《鑒上人秘方》，可惜沒有傳下來。在大和上的傳播下，中醫也在日本開花結果。因此，日本人把大和上稱為“日本漢方醫藥之祖”。以下36種藥草都是鑒真帶往日本推動使用的：
麻黃、細辛、芍藥、附子、遠誌、黃芪、甘草、苦參、當歸、柴胡、川芎、玄參、地黃、紫蘇、丹參、黃芩、桔梗、 旋覆花、蒼術、知母、半夏、蕪花、梔子、五味子、黃柏、杏仁、厚樸、和厚樸、肉桂、杜仲、唐木瓜、大棗、蜀椒、 花椒、吳茱萸。
一直到十七、十八世紀時，日本藥店的藥袋上，還印著鑒真的圖像，可見其影響之深。
大和上為太上皇治好了病，天皇喜上加喜，就把新田部親王的舊宅贈給了大和上，普照和思讬聽了之後大喜。請大和上以此地為伽藍，傳播《四分律藏》、法礪大師的《四分律疏》、《鎮國道場飾宗義記》、宣律大師的《鈔》，以持戒的力量，保護國家的安寧和秩序。大和上聽了他們的建議後，說：“這太好了，這樣一來四方的僧人就有地方可以住，我們的律法就可以發揚光大。”
日天平寶字元年，公元757年，十一月二十三日，天皇把備前國(今日本岡山縣)的水田一百町（1町相當於中國14．88畝）賜給唐禪院以供養四方僧人。
這天，大和上受中納言從三位冰上真人的延請，來到新田部親王的舊宅，他進入這座宅子，就感覺到此宅有珠光寶氣環繞。他私下裏從地上撚起一抹土來，放在嘴裏麵嚐了一下，鑒真連連點頭：“嗯，不愧是寶地，這裏可以立寺，而且我斷定這座寺建成之後，一定可以屹立幾千年而不倒。”大和上由徒弟法智攙扶著回去的時候，連連對法智說：“真是一塊福地呀，可以立伽藍，絕對可以立伽藍。”法智不解，他不明白大和上以什麼來判斷這塊地的價值。如果真如大和上所說的，那得等到幾千年後由後人去證實了。
既然已經有了基地，破土動工之事也就沒有必要再耽誤了。大和上立即主持僧匠和弟子們奠基石，搭架子、修椽木，眼看著一座金堂的架子已經起來了。大和上曾在江淮一帶，在南歸時主持修建的寺廟難以計數，因此對整個寺廟建造的流程、細節和注意事項當然非常嫻熟。雖然他看不到，但這些廟堂就好像在他的心裏有一幅畫，畫到哪裏，他知道得一清二楚。有些僧匠忽略了的地方，倒是他先記起來。
就在這時候，普照送來了一樣東西，名叫甍。甍是放在寺院棟梁之上的一段鴟尾，它對整個房梁起著支撐性的作用，相當於屋脊，沒有它，整個房梁就沒有著力重心。普照送來的這條甍，上麵有一個很深的龜裂紋，他把它交給了負責建寺的工事，囑咐他一定要把這條甍用在金堂的棟梁之上。後來思讬問起普照捐這條甍的深義時，普照說：“大和上來日之後，我國僧界煥然一新，大和上就像是這金堂上的甍一樣，支撐起了整個天平時代的佛光文化，大和上就是這‘天平之甍’！”