我們前麵已經大致了解了中醫學中有關人體結構和生理的內容：髒腑、經脈、氣血、津液等等以及表裏、寒熱、虛實等病理的內容。本節中我們結合陰陽學說將以上的內容重新疏理一遍。
人體如以內外分陰陽，則人體之內屬陰，人體之外屬陽。如果以人體前後分陰陽，則背部外露一點屬陽，腹部內含一點屬陰。如果以人體上下分陰陽，則上部屬陽，下部屬陰。如果以人體四肢和軀幹分陰陽，則四肢在旁屬陽，軀幹在中屬陰。拿髒與腑比較分陰陽，五髒藏於內，應該屬陰，腑在外，應該屬陽。但就五髒本身而言，心、肺處於上，屬陽，肝、脾、腎處於下，屬陰。再把心、肺來比較，心居中，屬陽中之陽，肺處於兩旁，屬陽中之陰。而把肝、脾、腎三個陰髒來比較，則肝在上，為陰中之陽，腎在下，為陰中之陰，脾髒藏最深，為陰中之至陰。所以《黃帝內經》中說：“清陽出上竅，濁陰出下竅。清陽發腠理，濁陰走五髒。清陽實四肢，濁陰歸六腑。”“夫言人之陰陽，則外為陽，內為陰。言人身之陰陽，則背為陽，腹為陰。言人身之髒腑中陰陽，則髒者為陰，腑者為陽。肝、心、脾、肺、腎五髒皆為陰，膽、胃、大腸、小腸、膀胱、三焦六腑皆為陽。故背為陽，陽中之陽心也；背為陽，陽中之陰肺也。腹為陰，陰中之陰腎也；腹為陰，陰中之陽肝也；腹為陰，陰中之至陰脾也。”
氣、血、津、液四者來比較，氣無形屬陽，血和津液有形屬陰。如拿津和液來比較，津輕清屬陽，液重濁屬陰。所以《黃帝內經》中說：“陽化氣，陰成形。”“味厚者為陰，薄為陰之陽。”
精、氣、神三者中，精屬陰，氣屬陽，神者陽中之陽。
對表裏而言，則表屬陽，裏屬陰。對寒熱而言，則熱屬陽，寒屬陰。對虛實而言，則虛屬陽，實屬陰。《黃帝內經》所謂：“外為陽，內為陰。”“陽勝則熱，陰勝則寒。”
用陰陽來標誌人體的髒腑器官組織，可以用來說明人體各部分的陰陽屬性特點，它們之間相互關係以及變化的趨勢。最重要的，是為臨床辯證和病機分析服務，這一點，我們後麵還要談到的。
從以上的陰陽在人體中的分配來看，一個髒器在某種場合屬於陽，而在另一場合又可以屬於陰。似乎有一點不確定性，其實這正是陰陽學說的實質所在。在上一節中說到陰陽是相對的、比較而言。體現在髒器陰陽屬性的確定上，那就是在某一場合屬陽的髒器，在另一場合就可能屬陰，這要根據與之處於相對立位置上的另一髒器的情況而定。說得直白一點，看一個髒器屬陰屬陽，要先看與之比較的另一髒器。也就是看與之一同裝進太極圖圈子中比較的是何髒器。比如肝髒與心髒，心在膈上，肝在膈下，則心為陽，肝為陰。如果換成肝髒和腎髒比較，肝在上，腎在下，這時腎為陰，肝就是屬陽了。所以一個事物的屬陰屬陽，隻是與它事物相較而言，事物本身並沒有實質性的改變。另外，不管是屬陰的或是屬陽的，都是物質性的，是客觀的存在。比如說氣無形，與有形的器官本體比較屬於陽。但是氣亦是屬於物質，是器官組成的一部分，是太極圖那個圈子當中的一部分，氣的作用是氣本身功能的表現，而不是器官本體（陰）的功能表現。這一點我們要分辨清楚。
不過具體到某一特定的器官時，陰陽是比較固定的。一般情況下陰是指髒器的本體，陽是指髒器中氣的功能。陰是基礎，陽是在陰的基礎上發揮的作用。所以就先後關係來說，應該是先有陰，然後有陽。這從精、氣、神的陰陽關係上也可以看出，《黃帝內經》說：“故生之來，謂之精，兩精相搏謂之神。”先由精生，然後氣立，最後神至。《黃帝內經》還有說：“兩神相搏，合而成形，常先身生，是謂精。”“人始生，先成精。”這些都說明了陰的主導作用。所以《黃帝內經》說：“陰在內，陽之守也；陽在外，陰之使也。”說明了髒器陰陽之間的體用關係。還要說明一下，這個髒器之用（功能）應該是物質性的。
以上的說法並無貶低陽的意思。在人體陰和陽的關係中，陰多屬有形，陽多屬無形，無形必須依附於有形，所以先有陰，然後才能有陽的表現。但是陰主靜，陽主動，陽是人體生長發育以及一切髒腑活動的原動力所在。沒有陽的作用，就沒有升降出入，就無以生長化收藏，由此可見陽的存在的重要意義了。所以陰和陽是一個整體中的兩個部分，陰離不開陽，陽離不開陰，兩者互相依存，互相為用，共同完成人體的生理功能。《黃帝內經》中所說的：“陽生陰長，陽殺陰藏。”正是說明了兩者之間互相依存，互相為用的關係。
經絡的陰陽，在前麵經絡一節中已經說過，本節中就陰陽問題再簡單地補敘一下。
十二經脈中有六條屬陰，六條屬陽。六髒（五髒合心胞絡）屬於陰，所以六條屬陰的經脈是歸屬於六髒的。六腑屬於陽，所以六條屬陽的經脈就歸屬於六腑。人體背為陽，腹為陰，外為陽，內為陰。所以屬陽的經脈都循行於背部和四肢的外後側麵，屬陰的經脈都循行於腹部和四肢的內側麵。