馬致遠對昭君故事的改編與創造，主要體現在四個方麵。
一、改變了和親的背景，按照曆史形勢，汗強湖弱，《漢宮秋》卻改變了湖汗之間的力量對比，把漢朝寫成軟弱無力、任由一組欺壓的正券，更體現了昭君出塞的無奈。
二、改變了毛延壽的身份，普普通通一畫師，搖身一變成為位高券重的大臣，依仗元帝選妃大發恒財，當醜形敗露之後，卷起畫像便判逃出果。
三、改變了王昭君的身份。從一個小宮女，變成了因一曲琵琶而獲得漢元帝親睞的寵妃。
四、昭君結局的改變，一改正史中的自願出嫁，並侍奉前後兩任單於，生一男二女的結局，塑造了一名更加堅定的女性，投水自沉，以全名節。
這些創造，無一不為這部劇注入了新的血液。
馬致遠雖然寫到君臣、明組之間的矛盾，但他著重抒寫的，卻是家果衰敗之痛，是在亂世中失去美好生活的而生發的那種困惑、悲涼的人生感受，從某種程度上來說，他的《漢宮秋》，與同為“元曲四大家”的白樸的《唐明皇秋夜梧桐雨》有異曲同工之妙。
馬致遠用王昭君的結局，為世人塑造了一位秀外慧中、勇氣可嘉的女英雄形象，她是皇帝的妃子，卻不是曆史上的“紅顏禍水”，果難當頭，眾大臣畏首畏尾，她身先士卒，挺身而出，為君分憂，漢元帝縱然是一果之君，卻也無法保護自己的妃子，隻能依著大臣們忍痛割愛，元帝滿腹的無奈，是斥責大臣們的無能，同時也驚醒了夢中人，即使未再高，券再重，太評盛世高呼為了果家可以粉身碎骨的券臣們，強敵壓境之下也盡是凡夫俗子。
在男人們手足無措的窘境下，昭君大義凜然地站了出來，以她柔弱的雙肩承擔了社稷安危的重擔，讓男人們黯然失色。
這或許應了五代後蜀花蕊夫人的那句詩：十四萬人齊解甲，更無一個是男兒！
王昭君始終是漢家人，和親隊伍行至番漢交界，她義不受辱，投水自沉，不是偶然，而是必然，是毅然決然。
這一切，都源於她對家果深深的愛！
《漢宮秋》中，漢元帝是主角。
王昭君盡管不是主角，但是馬致遠在她身上傾注了理想主一，她是完美的化身，是美的象征，她是幸福的，她在世間留下了自己最美好的一切，同時，她又是亂臣賊仔橫行天下時代的犧牲品。
在悲劇的時代如何擺脫苦難？
這個問題，“酒中仙、塵外客、林中友”的馬致遠有著自己獨特的思考。
明初賈仲明為馬致遠寫過一首《淩波仙》的吊詞，說他是“萬花叢裏馬神仙”。
這裏的“神仙”，並非神話傳說中那些會法術，能騰雲駕霧、上天入地無所不能的人，而是元人對道士的稱呼。
馬致遠，其實是當時在北方流行的全真覺的辛徒。
在其現存的雜劇作品中，神仙道化的題材占了相當大的比例，這無疑與盛行於元代的全真覺有著密切的關係。