孟鳴前期發行的帶標點符號的《詩經》，也引起了反響，但也有反對的聲音，就是一些老古董。儒家崇尚的大同世界在三皇五帝時代，複古、崇古甚少疑古、辯古。這是理學還沒發軔，儒學從唐朝傳承而來，還雜亂無章。唯一都被認可的是仁、孝、忠、信，並沒有統一的流派。理學還沒冒頭，周敦頤還沒出生呢。孟鳴近期被人攻訐了，說孟鳴以祥瑞進幸，褻瀆經義，其罪可誅。顯然對他的標點符號的應用進行攻訐。其實那個時代都有一群人，曲解經義，以為己用，以為自己是儒家正宗，不符合自己觀點的就視為離經叛道。其中以國子監的教授魏留行，對孟鳴攻訐最甚。孟鳴也決定出書駁斥，並在 東京早報發表署名文章《古為今用，推陳出新，與時俱進》的文章，指出不可厚古薄今，儒家學說諸多被曲解的地方，甚至出現了偽作。指出現行的《古文尚書》有一部分可能係偽作，《尚書》相傳由孔子編撰而成，但有些篇是後來儒家補充進去的托古作品。清初閻若璩著《古文尚書疏證》、惠棟著《古文尚書考》，辨析詳明、證據周密，讓偽書無處可躲。孟鳴引用了其中的最有利的證據，論證是偽作。他提出了王陽明的“知行合一，躬行實踐”的理論，提出實踐是檢驗一切真理的標準，指出空談誤國，實幹興邦。
孟鳴的文章一發表就引起了巨大的爭議，許多儒學大家加入了爭辯，《古文尚書》幾乎被認定為偽作。帶來的影響是巨大，視為圭臬的聖典就失去了光環，儒生的信仰受到巨大的衝擊，處於迷茫中。孟鳴接著又發表了一篇《儒學之使命》：其中寫出來儒學的發展曆程，從孔孟到董仲舒，從百家爭鳴到焚書坑儒再到獨尊儒術。指出來儒學的積極作用，也指出了現在儒學的局限。提出儒學的使命：“尊順天意，立天、立地、立人，做到誠意、正心、格物、致知、明理、修身、齊家，治國平天下，知行合一，努力達到聖賢境界。”總結為四句話：“為天地立心，為生民立命，為往聖繼絕學，為萬世開太平”。但忠君愛國是前提。
此文一出自孟氏的北海學派產生了，竟引起了眾多讀書人的共鳴，奄然給眾人迷惘的眼前打開了一扇大門，可以做為今後的行動準則。一時間眾儒生使命感滿滿、豪情無限，竟在內心裏引之為圭臬了。魏留行之輩鴉雀無聲了。孟鳴的世界一時清淨了許多。唯一的好處是《東京早報》發行量大增，這兩期都增發了十萬份，被帶往了全國各處。
現在朝堂也不平靜，出奇地一致關注著這場儒學之爭，孟鳴寫的兩篇文章很快擺在了官家和朝中大佬的書案前，最後官家把朝中重臣、國子監名師、經學大家召集一堂，討論這場學術論戰。最後孟鳴的兩篇文章辨析詳明、證據周密，符合經義，所以可引為經典，可為圭臬。 “知行合一，躬行實踐”的理論。最後被孔衍公下令引入孔府的典籍中，刻於孔廟中。